Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  62  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16154435--16154558
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64
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0
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14
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20
20
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1.97
16154893--16155302
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2.3
177
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2
509
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1.98
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17
1.9
17
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3
0
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2.0
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100
0
60
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2.5
29
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29
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89
29
28
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28
1.94
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77
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92
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20
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27
20
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8
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10
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2.0
21
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16190481--16190526
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2
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57
28
0
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17
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2.1
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0
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0
227
36
24
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2.1
21
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0
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2.0
25
100
0
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3
27
17
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
33
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0
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18
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15
14
1.77
16214584--16214656
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2.0
36
82
15
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24
6
6
61
1.46
16215052--16215131
26
3.0
26
80
3
88
30
5
7
57
1.48
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2
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2
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0
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10
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16218393--16218518
19
6.9
19
84
10
183
38
10
15
35
1.82
16218393--16218518
35
3.5
36
82
11
168
38
10
15
35
1.82
16218393--16218518
54
2.3
54
95
0
225
38
10
15
35
1.82
16218393--16218541
19
7.8
22
77
17
76
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9
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36
1.81
16223335--16223369
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1.9
18
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0
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28
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32
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57
0
2
40
1.12
16232521--16232582
27
2.2
28
80
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74
58
0
1
40
1.08
16236168--16236251
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2.0
42
92
0
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46
2
14
36
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1.9
19
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0
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54
0
0
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1.00
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69
4
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4
1.24
16238351--16238427
40
1.9
40
83
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31
19
19
29
1.96
16241595--16241703
33
3.2
33
85
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24
27
28
19
1.98
16242247--16242279
18
1.9
17
88
11
50
27
15
12
45
1.81
16243560--16243629
28
2.4
29
83
2
88
27
30
17
25
1.97
16243914--16244008
42
2.3
42
96
0
172
31
22
16
29
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
16248902--16249007
52
2.0
52
100
0
212
47
22
5
24
1.73
16249784--16249891
26
4.2
26
94
2
175
34
4
24
37
1.76
16251376--16251428
26
2.0
26
85
7
72
37
22
15
24
1.92
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2.1
137
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556
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19
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1.98
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26
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141
34
4
22
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1.76
16257293--16257345
26
2.0
26
82
7
63
37
20
15
26
1.92
16257593--16257879
137
2.1
137
98
0
556
24
19
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1.98
16263631--16263672
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0
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1.85
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23
35
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22
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0
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1
0
35
1.03

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438