Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  77  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20696616--20696766
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75
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185
2.0
185
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1.77
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1
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3
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17
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20720199--20720423
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1
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12
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12
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1
5
30
1.23
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2.0
32
83
16
82
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1
4
33
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
26
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23
2.2
23
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56
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2
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1.48
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12.1
176
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18
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1.98
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23
18
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24
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22
21
35
1.96
20732840--20733739
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10.3
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20
22
21
34
1.96
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22
22
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1.97
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22
22
34
1.96
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22
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0
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12
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1.22
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12
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5
30
1.23
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1.26
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2.0
26
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54
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1.55
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23
2.2
23
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2
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0
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0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20749280--20749318
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2.6
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2.7
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14
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4.0
29
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25
22
14
37
1.92
20762913--20763015
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29
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188
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24
14
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1.93
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207
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25
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1.93
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48
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26
20
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1.99
20765348--20765622
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141
2.0
141
85
1
374
32
15
21
30
1.94
20802501--20802875
192
2.0
188
81
4
441
35
15
19
29
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20803127--20803160
14
2.5
14
85
4
52
70
11
0
17
1.16
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37
1.9
36
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2
95
18
10
1
70
1.23
20803834--20803915
16
4.8
16
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14
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21
8
1
68
1.24
20803906--20803944
19
2.1
19
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9
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20
7
0
71
1.10
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3
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0
0
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0.91
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46
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20
19
29
30
1.97
20806904--20807072
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1.8
93
92
0
284
21
19
28
30
1.97
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2.0
29
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59
1
0
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1.08
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12
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0
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0
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2.1
19
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40
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26
23
24
2.00
20836265--20836488
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2.8
80
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25
26
23
24
2.00
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19
4.1
19
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5
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1.86
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32
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24
1.97
20843750--20843853
50
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24
1.97
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1.9
18
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0
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35
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42
20
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1.9
21
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62
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3.3
39
83
4
163
23
28
25
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20867230--20867359
40
3.3
39
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4
163
23
28
25
23
1.99
20874905--20875086
50
3.6
49
83
4
143
31
28
16
24
1.96
20874951--20875088
50
2.7
51
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2
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31
28
15
23
1.96
20874954--20875090
52
2.7
50
87
2
175
32
28
15
24
1.95
20886457--20886579
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2.0
60
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1.98
20893155--20893214
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2.0
29
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0
0
50
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23
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1.98
20959670--20959722
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26
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7
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26
15
20
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1.97
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20
11
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26
2.0
27
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24
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1.92
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1.98
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4.6
15
83
0
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11
17
13
57
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
20973726--20973813
30
3.0
30
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8
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10
17
15
56
1.66
20976199--20976374
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46
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10
232
20
21
29
28
1.98
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1.8
93
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0
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1.98
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0
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22
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1.98
20988317--20988416
47
2.1
48
92
1
166
27
22
21
30
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438