Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  218  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67299737--67299773
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14
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8
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67299736--67299772
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1.17
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0
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3.3
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0
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2.1
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0
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3.4
14
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13
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27
15
28
27
1.96
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30
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30
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1.27
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17
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16
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2
18
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3.2
30
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2
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25
14
29
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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47
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1.94
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3.2
30
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2
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28
26
15
28
1.96
67329516--67329563
15
3.3
15
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5
53
31
0
25
43
1.55
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29
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29
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0
93
30
0
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41
1.56
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1.9
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12
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53
1.55
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9
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0
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0
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11
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15
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1.55
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29
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30
0
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41
1.56
67336532--67336581
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2.5
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66
30
12
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54
1.55
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19
2.1
19
85
0
53
25
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1.95
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19
2.2
19
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21
28
1.99
67338794--67338833
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7
7
12
1.27
67338793--67338834
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3.7
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90
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70
73
7
7
11
1.23
67346681--67346710
10
2.9
10
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51
20
20
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1.83
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4.7
40
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21
27
26
1.99
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80
2.8
80
83
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270
25
21
26
26
1.99
67352201--67352240
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2.2
18
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4
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5
22
0
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1.04
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19
2.8
18
85
11
59
6
14
6
74
1.21
67352201--67352299
30
3.3
30
69
9
85
5
20
3
71
1.18
67358447--67358534
30
2.9
30
78
6
88
29
23
17
29
1.97
67361609--67361685
29
2.7
29
95
2
138
25
15
31
27
1.96
67364214--67364323
26
4.2
26
97
0
184
36
24
5
33
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67368329--67368370
18
2.3
18
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69
4
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7
1.31
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2.2
20
88
0
63
35
11
2
51
1.50
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43
2.2
41
79
3
98
27
19
23
29
1.98
67382109--67382170
32
1.9
32
96
0
115
32
4
16
46
1.68
67386219--67386330
39
2.9
39
91
0
179
29
28
20
21
1.98
67387225--67387273
20
2.3
22
86
10
66
42
14
8
34
1.75
67388172--67388268
30
3.2
30
73
2
97
28
16
26
27
1.97
67390481--67390562
30
2.7
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87
10
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1.37
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3.1
18
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51
7
19
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69
1.27
67390538--67390562
12
2.1
12
100
0
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20
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1.11
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1.05
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3.2
30
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26
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1.97
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3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
67427168--67427297
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2
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18
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19
4
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19
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19
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60
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0
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1
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2.00
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1.99
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11
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1.12
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1.99
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22
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1.99
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1.95
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54
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29
1.84
67502249--67502620
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4.6
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29
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40
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26
22
26
24
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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1.94
67516494--67516588
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3.1
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24
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24
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26
22
21
28
1.99
67516780--67516898
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2.5
48
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5
170
26
22
21
28
1.99
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20
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0
156
23
21
25
29
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67555592--67555707
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1.98
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3.0
316
97
1
1758
29
20
21
28
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438