Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  57  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14755423--14755470
25
1.9
25
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0
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25
16
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1.96
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10
0
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1.37
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31
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23
23
15
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1.94
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6.0
24
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209
26
22
22
28
1.99
14759787--14759928
47
3.0
48
90
5
207
26
22
22
28
1.99
14759786--14759929
71
2.0
72
89
4
220
26
22
22
29
1.99
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1
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80
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0
15
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21
3.4
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80
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77
82
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2
0.79
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4.4
44
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144
34
15
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18
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1.95
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4.2
83
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0
589
32
20
19
27
1.97
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18
4.8
18
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13
37
1.81
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133
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12
37
1.81
14767665--14767771
7
15.7
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69
18
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4
0
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1.20
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21
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21
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36
5
0
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0
0
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2.0
26
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72
39
22
11
26
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2.9
28
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88
36
20
22
20
1.95
14778342--14778541
27
7.4
27
84
2
213
26
16
19
38
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14779901--14780065
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49
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10
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25
17
28
28
1.98
14781591--14781638
17
2.9
17
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14
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31
2
0
66
1.03
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27
3.5
28
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5
103
35
25
13
27
1.92
14807190--14807296
42
2.5
42
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205
22
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14
29
1.93
14815133--14815202
27
2.6
27
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24
14
27
1.94
14818104--14818188
25
3.4
25
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9
84
31
25
18
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1.97
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2.4
19
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66
0
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51
0
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0
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1.20
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2
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3
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1
0
70
0.94
14833146--14833237
12
7.1
14
77
15
92
28
1
0
70
0.94
14833146--14833237
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120
28
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0
70
0.94
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0
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16
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51
0
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38
1.35
14835121--14835185
28
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67
40
0
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2.1
19
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9
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26
10
5
57
1.53
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2.0
13
100
0
52
53
0
0
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1.00
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17
2.3
17
95
0
69
12
7
48
30
1.69
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14851387--14851462
39
2.0
38
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7
91
26
27
23
22
1.99
14852638--14852673
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2.0
18
88
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52
2
0
44
1.15
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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0
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1.25
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33
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18
2.2
19
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12
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29
24
0
46
1.53
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2.0
18
88
0
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52
2
0
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1.15
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5
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41
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15.7
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61
6
0
32
1.21
14865649--14865761
27
4.2
26
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22
23
16
1.93
14865649--14865761
54
2.1
54
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156
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22
23
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4.1
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36
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22
17
1.94
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21
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26
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85
30
22
22
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25
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2
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25
23
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2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
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1
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1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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16
29
27
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438