Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  290  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90874537--90874583
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594
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90878653--90879321
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4.8
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18
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1.98
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2.7
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2
21.0
2
90
0
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2
2
50
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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36
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0
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20
2.1
20
86
8
59
30
7
7
54
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
90986617--90986657
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2.0
21
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1.87
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20.7
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19
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1.52
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19
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17
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1.95
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258
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1.96
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1.97
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24
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23
2.2
22
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10
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14
10
20
56
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91071623--91071659
15
2.6
15
87
8
51
56
10
16
16
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
80
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0
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1.9
106
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0
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17
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28
1.98
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2
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19
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28
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0
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0
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1.83
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1.97
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5.0
50
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1
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1.98
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1.8
101
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1.98
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1.9
150
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1.98
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28
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0
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1.95
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1.97
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1.97
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21
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1.89
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7
242
24
20
30
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91138362--91138583
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23
1.99
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1.99
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25
27
21
24
1.99
91143521--91143705
40
4.7
40
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0
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1.99
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100
0
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32
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6
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2.5
12
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0
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10
23
50
16
1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91200179--91200560
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0
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1.98
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24
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26
22
22
28
1.99
91211173--91211315
71
2.0
71
89
5
218
25
22
22
29
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438