Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  240  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74493099--74493314
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28
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74511893--74511981
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0
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2.0
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100
0
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20
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4.8
12
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0
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1.75
74515123--74515179
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0
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1.75
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1.99
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40
2.8
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58
18
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21
2.8
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27
15
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1.89
74522815--74522916
42
2.4
42
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3
116
15
23
15
45
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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14
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2.1
16
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0
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1.80
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2.0
26
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26
21
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1.95
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0
0
50
1.00
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2.2
39
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1.98
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1.98
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2.9
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24
29
18
27
1.98
74548807--74549069
140
1.9
141
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365
23
29
18
28
1.98
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28
5.6
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142
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17
26
1.96
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3.3
56
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197
32
22
17
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1.96
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1.81
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2.1
47
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7
134
29
15
7
46
1.74
74558698--74558856
27
5.9
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82
11
184
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19
1.96
74558716--74558856
54
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234
34
22
24
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1.96
74562092--74562275
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225
24
21
27
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1.99
74562091--74562275
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4.7
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218
24
21
27
27
1.99
74562146--74562308
79
2.1
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20
26
26
1.99
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36
24
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1.83
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2.2
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87
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99
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9
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1.80
74586402--74586460
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35
2.0
35
100
0
140
40
11
8
40
1.72
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74589343--74589372
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1.9
16
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33
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0
43
1.54
74589584--74589861
50
5.5
50
77
3
227
32
26
16
25
1.96
74589633--74589814
101
1.8
101
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0
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30
25
17
26
1.97
74589576--74589861
151
1.9
152
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416
31
26
16
25
1.97
74594390--74594421
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2.4
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1.00
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143
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30
18
22
1.97
74597655--74597975
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217
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28
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1.95
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1.96
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40
3.6
40
81
3
121
28
23
26
21
1.99
74628183--74628310
40
3.2
39
82
8
143
24
21
28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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20
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0
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28
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2
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2
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4
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47
0
2
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1.14
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2
100
0
50
0
0
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1.00
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15
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2
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35
0
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1.42
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30
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28
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1
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1.49
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20
1.9
20
100
0
76
13
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1.93
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100
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301
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1.80
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64
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1.47
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23
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0
0
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25
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24
29
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123
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3.6
40
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1
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26
22
24
26
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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27
2.00
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19
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2.0
222
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0
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0
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0
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25
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36
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74717002--74717053
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2.9
18
88
0
77
61
13
3
21
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74717730--74717803
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2
0
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2.0
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2
0
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1.12
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0
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1.15
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4
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0
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4.9
110
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585
29
15
19
35
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438