Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   

This is table  92  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25497976--25498290
154
2.0
154
90
0
495
38
15
23
22
1.92
25498130--25498323
46
4.2
45
88
3
230
39
15
23
21
1.92
25498130--25498323
92
2.1
91
85
3
255
39
15
23
21
1.92
25519474--25519517
23
1.9
23
86
9
63
36
0
11
52
1.38
25525081--25525138
30
1.9
31
82
10
75
39
6
22
31
1.80
25525456--25525836
48
8.0
48
81
2
408
28
18
26
26
1.98
25525456--25525831
96
3.9
96
87
2
461
28
18
26
26
1.98
25525456--25525833
144
2.6
144
86
2
474
28
18
26
26
1.98
25531365--25531493
43
3.0
42
81
3
159
21
17
26
34
1.96
25538821--25538938
43
2.8
42
77
12
125
22
15
27
34
1.94
25541095--25541145
24
2.1
25
85
10
70
11
19
9
58
1.60
25552255--25552422
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
25558816--25558983
40
4.2
40
82
1
185
24
26
22
26
2.00
25561997--25562183
71
2.7
68
93
5
281
18
28
18
34
1.95
25562020--25562183
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
25562020--25562217
71
2.8
69
92
3
265
20
28
17
33
1.95
25565491--25565634
39
3.7
39
90
0
234
26
21
29
22
1.99
25565492--25565674
78
2.3
79
89
1
269
24
22
29
22
1.99
25573349--25573491
39
3.7
39
92
1
234
25
20
30
23
1.99
25573350--25573531
77
2.3
79
89
2
269
24
22
29
23
1.99
25589252--25589419
40
4.2
40
91
1
248
23
21
28
26
1.99
25596150--25596295
48
3.0
48
91
0
238
37
8
23
30
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25598238--25598356
40
3.0
40
93
1
195
20
23
30
26
1.98
25599259--25599302
23
1.9
23
85
0
61
36
6
11
45
1.67
25600516--25600661
48
3.0
48
89
0
229
38
8
23
30
1.84
25605432--25605550
40
3.0
40
91
1
186
20
22
30
26
1.98
25607714--25607859
48
3.0
48
87
0
211
37
8
23
30
1.84
25612032--25612107
23
3.3
23
80
9
91
21
23
19
35
1.96
25612032--25612118
23
3.7
23
79
15
90
24
21
19
34
1.96
25612041--25612149
23
4.6
23
76
17
80
23
20
20
35
1.96
25612088--25612165
25
3.2
25
76
18
76
28
20
21
29
1.98
25613534--25613701
46
3.7
46
70
21
158
29
27
21
22
1.99
25613627--25613712
46
1.9
45
88
4
129
30
29
19
20
1.97
25620571--25620740
92
1.8
92
96
0
313
28
28
21
21
1.99
25620566--25620737
46
3.7
46
80
11
217
29
27
21
21
1.99
25620568--25620756
46
4.1
46
73
17
151
28
28
21
21
1.99
25625759--25625915
43
3.7
42
68
8
122
24
19
24
31
1.98
25626183--25626229
23
2.0
23
100
0
94
25
17
17
40
1.90
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28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
25636571--25636671
28
3.5
28
86
6
114
29
13
26
29
1.94
25644321--25644443
44
2.8
43
71
4
113
21
20
25
32
1.98
25650453--25650520
30
2.3
30
97
0
127
50
13
4
32
1.61
25650672--25650711
21
1.9
21
89
0
62
35
17
0
47
1.48
25652015--25652068
26
2.1
26
89
0
81
24
24
12
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
25655811--25655846
17
2.1
17
89
0
54
33
8
8
50
1.63
25670251--25670371
51
2.6
47
79
10
133
23
17
28
30
1.97
25677852--25678192
170
2.0
170
99
0
673
31
8
19
40
1.82
25678307--25678336
2
15.0
2
100
0
60
50
0
0
50
1.00
25681245--25681284
21
1.9
21
89
0
62
37
15
0
47
1.45
25683740--25683863
39
3.2
39
92
1
194
25
33
18
22
1.97
25686769--25686814
23
2.0
23
100
0
92
43
8
26
21
1.81
25689015--25689068
14
4.0
13
83
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63
50
3
0
46
1.19
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20
2.0
20
84
0
51
38
5
15
41
1.69
25695444--25695625
79
2.3
81
83
9
223
24
28
22
24
2.00
25695423--25695626
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5.1
40
81
9
231
25
27
22
25
1.99
25702157--25702190
14
2.4
14
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17
1.79
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16
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2
0
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0
1
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0
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29
1.04
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0
1
31
1.01
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0
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19
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0
60
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7
12
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1.72
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27
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1
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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1.91

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          433   434   435   436   437   438