Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  31  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
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Period
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Copy
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Indels
Score
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1.9
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25
33
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7812997--7813052
25
2.2
25
83
6
67
30
7
3
58
1.42
7812985--7813055
27
2.7
26
71
18
65
32
7
4
56
1.46
7825525--7825559
12
2.8
13
86
8
54
22
11
5
60
1.52
7825571--7825820
70
3.5
69
81
4
257
28
17
23
30
1.97
7825840--7826002
88
1.9
87
85
6
231
28
19
17
34
1.95
7825993--7826231
87
2.8
84
80
9
241
25
17
19
37
1.93
7826262--7826437
71
2.4
74
84
2
223
26
17
25
31
1.97
7826553--7826647
44
2.2
44
94
0
163
28
12
24
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1.92
7828159--7828247
43
2.0
44
95
2
162
20
22
12
44
1.84
7828891--7828968
11
6.8
11
78
19
56
64
1
1
33
1.10
7828905--7828970
3
22.0
3
85
11
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1
0
33
1.02
7828907--7828970
35
1.9
32
90
9
101
65
1
0
32
1.02
7828903--7828971
19
3.8
18
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13
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63
1
0
34
1.03
7834546--7834579
14
2.7
12
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13
50
35
2
17
44
1.64
7836599--7836646
23
2.0
24
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8
71
64
0
6
29
1.18
7836668--7836866
3
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3
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10
147
61
3
5
30
1.32
7838415--7838494
41
2.0
41
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5
108
30
17
16
36
1.92
7838613--7839312
93
7.6
92
72
14
550
28
20
17
32
1.96
7838866--7839172
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6.8
44
70
12
187
28
23
17
30
1.97
7839144--7839221
41
1.9
41
83
0
102
25
21
20
32
1.98
7838867--7839327
45
10.2
44
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13
256
28
21
17
32
1.96
7838420--7839311
182
4.9
182
90
0
1363
28
21
17
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7839333--7839534
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68
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0
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21
26
25
1.99
7839531--7840321
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9.2
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86
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24
21
31
1.98
7842992--7843046
2
29.0
2
78
10
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52
7
0
40
1.29
7842992--7843043
22
2.3
23
90
6
88
53
7
0
38
1.30
7843564--7843600
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3.2
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45
0
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0
1.00
7843562--7843611
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11
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9
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44
0
56
0
0.99
7844322--7844423
35
2.9
35
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1
179
21
12
49
16
1.79
7845134--7845280
54
2.9
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80
12
183
34
19
16
29
1.94
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147
4.1
140
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4
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31
19
15
32
1.94
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6.9
70
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31
20
15
32
1.94
7845337--7845925
217
2.7
217
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2
1066
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19
15
32
1.94
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1.78
7855177--7855310
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216
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24
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1.78
7855186--7855311
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5
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1.77
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0
0
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3
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0
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0
0
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6
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19
309
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20
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1.95
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2.1
14
93
0
51
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6
10
16
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7861759--7862147
161
2.3
163
86
6
543
33
20
16
29
1.95
7861887--7862147
85
3.1
85
81
7
343
34
18
16
30
1.93
7861976--7862217
81
3.1
75
82
13
248
32
19
16
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1.94
7870495--7870539
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2.0
22
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0
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5
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26.3
9
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17
127
61
4
1
31
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438