Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   

This is table  40  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9967585--9967617
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2
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0
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0
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1.00
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23
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2.00
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0
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0
0
48
1.00
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2
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2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
9980139--9980458
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7.0
46
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1
410
40
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1.89
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2.0
42
100
0
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18
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0
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2.0
31
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0
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0
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6
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3.7
21
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15
68
40
17
6
35
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16
10
36
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17
3.5
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9
60
35
16
10
37
1.83
10006033--10006123
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4.9
19
89
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152
36
16
10
36
1.84
10006242--10006280
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1.9
20
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2
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45
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1.9
89
89
0
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27
29
13
29
1.94
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2.2
79
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4
273
27
23
17
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11.2
44
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575
29
28
13
28
1.95
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1
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1
75
0
58
1
12
0
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0.63
10008423--10008496
7
10.6
7
79
12
73
1
12
0
86
0.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10008423--10008496
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24
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9
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1
12
0
86
0.63
10008424--10008496
30
2.4
32
88
6
107
1
12
0
86
0.64
10014078--10014153
22
3.7
21
76
15
68
40
17
6
35
1.75
10014114--10014204
35
2.5
37
89
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141
36
16
10
36
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10014128--10014183
17
3.5
15
88
9
60
35
16
10
37
1.83
10014114--10014204
19
4.9
19
89
8
152
36
16
10
36
1.84
10014988--10015029
18
2.3
18
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0
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1.75
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85
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27
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1.99
10029234--10029490
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27
27
21
23
1.99
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0
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0
0
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22
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26
1.99
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20
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37
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0
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1.80
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13
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51
27
10
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1.28
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2.0
68
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0
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31
20
0
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1.56
10055301--10055342
5
8.4
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85
15
52
2
16
0
80
0.81
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19
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17
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20
1
71
1.15
10055719--10055766
20
2.3
21
75
13
55
43
16
0
39
1.48
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
10056230--10056269
20
2.0
20
100
0
80
40
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10
15
1.80
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41
3.2
41
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172
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20
2.0
20
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69
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23
15
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1.92
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59
2.0
59
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211
45
20
11
22
1.83
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59
2.2
58
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163
49
20
7
23
1.74
10062282--10062317
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18.5
2
88
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56
50
2
0
47
1.15
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12
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2.0
40
97
0
155
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1.50
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13
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6
0
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1.16
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4
10
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1.58
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0
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31
16
14
1.90
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8
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4
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13
0
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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58
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1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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253
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18
20
29
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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          433   434   435   436   437   438