Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  22  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5779934--5779982
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2.3
23
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62
0
1
35
1.06
5779974--5780038
27
2.5
26
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0
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6
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1.24
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12
167
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20
1.64
5805269--5805317
23
2.1
23
100
0
98
4
4
63
28
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5805221--5805324
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2
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23
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5811562--5811620
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2.0
30
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5
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1.9
21
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10
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35
0
7
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1.27
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1
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2.0
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0
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2.2
22
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2
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22
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2.0
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0
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1
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2.0
31
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35
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1.62
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2.2
24
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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Entropy
(0-2)
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2.9
29
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86
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0
0
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0
58
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20
17
0
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5944537--5944606
7
10.0
7
89
4
106
27
0
0
72
0.84
5944953--5944996
18
2.4
18
88
11
63
56
4
2
36
1.32
5945583--5945634
16
2.9
18
78
18
56
51
0
1
46
1.12
5949527--5949562
19
1.9
19
88
5
56
66
0
0
33
0.92
5949526--5949598
28
2.6
28
81
10
87
60
2
2
34
1.25
5949877--5949933
18
3.1
18
69
14
53
61
1
7
29
1.32
5949859--5949933
37
2.0
37
89
5
116
60
2
6
30
1.37
5949562--5950108
285
1.9
277
84
9
721
50
6
7
35
1.55
5952613--5952641
2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
5958361--5958537
39
4.5
39
92
1
300
27
27
23
20
1.99
5958530--5958661
39
3.4
39
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2
203
25
25
18
29
1.98
5958361--5958654
78
3.7
78
85
5
251
27
26
22
23
1.99
5958353--5958661
117
2.6
118
79
7
299
27
26
21
24
1.99
5969951--5970137
60
3.2
60
86
4
281
20
19
19
39
1.93
5969963--5970136
57
3.0
57
88
2
258
18
20
20
40
1.91
5971024--5971050
9
3.0
9
100
0
54
44
0
44
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1.39
5972009--5972077
22
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21
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15
7
10
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1.42
5972211--5972240
14
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0
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50
0
0
50
1.00
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2.3
11
100
0
50
8
28
0
64
1.22
5981353--5981377
13
1.9
13
100
0
50
0
12
0
88
0.53
5981931--5981979
15
2.9
17
75
22
50
59
2
2
36
1.21
5981933--5981982
24
2.1
24
82
14
59
62
2
2
34
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5982992--5983028
13
2.5
15
87
12
51
43
0
5
51
1.24
5988804--5988842
18
2.2
17
95
4
69
41
20
5
33
1.74
5996843--5996881
20
2.0
21
85
10
55
64
0
0
35
0.94
5999637--5999813
88
2.0
88
87
2
257
31
23
15
28
1.96
6000713--6001004
132
2.2
130
87
1
404
24
25
17
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1.96
6003697--6003806
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4.2
26
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0
175
37
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5
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1.78
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2.2
19
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0
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31
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24
1.97
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76
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4
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1.39
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2.0
36
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18
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1.74
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29
2.0
29
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78
46
1
0
51
1.11
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19
3.6
19
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2
2
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1.29
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19
3.3
18
78
14
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56
1
3
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1.25
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17
3.9
17
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18
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55
2
0
41
1.15
6013265--6013395
68
1.9
70
93
3
230
51
4
3
40
1.41
6016117--6016162
22
2.2
22
84
7
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26
0
4
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1.07
6016133--6016190
24
2.4
24
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13
66
31
0
3
65
1.09
6016133--6016190
26
2.4
24
81
13
66
31
0
3
65
1.09
6017662--6017776
27
4.3
26
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5
149
36
23
23
16
1.94
6017662--6017776
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
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26
3.2
26
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0
150
36
25
4
33
1.77
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27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
6024884--6024998
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6026613--6026696
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
6032120--6032234
27
4.3
26
87
5
149
36
23
23
16
1.94
6032120--6032234
54
2.1
54
88
3
169
36
23
23
16
1.94
6032337--6032399
25
2.4
25
86
7
81
31
12
23
31
1.92
6033845--6033928
26
3.2
26
96
0
150
36
25
4
33
1.77
6034693--6034729
19
2.1
19
85
10
51
51
0
8
40
1.32
6036527--6036580
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1.9
28
100
0
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2.0
21
90
0
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1.38
6043229--6043272
21
2.1
21
87
8
63
75
0
9
15
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438