Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  293  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91838167--91838228
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4
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33
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2.2
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91844576--91844641
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116
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0
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58
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5
242
29
13
19
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3.5
30
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124
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29
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1.97
91924225--91924805
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4.5
131
76
6
477
32
16
13
37
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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95
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1
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91926267--91926374
54
2.0
54
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0
207
21
16
12
50
1.77
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2.5
35
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25
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10
43
1.84
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31
3.1
31
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24
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248
26
21
22
29
1.99
91929089--91929256
71
2.3
71
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4
248
26
21
22
29
1.99
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3.0
20
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2.4
27
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20
24
20
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1.96
91930731--91930786
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2.1
26
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10
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1.78
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27
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257
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5.9
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27
1.85
91930856--91931176
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4.0
81
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4
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23
27
1.85
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2.4
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1.83
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1.9
45
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0
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15
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1.99
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63
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19
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1.9
22
95
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40
21
19
19
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5.2
9
78
17
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42
11
1
44
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
91972182--91972233
20
2.5
20
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42
11
1
44
1.51
91974178--91974212
6
5.8
6
100
0
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17
14
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1.90
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50
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57
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16
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19
1.60
91987747--91987795
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10
0
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28
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25
25
2.00
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100
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3.2
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145
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1.86
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27
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28
8
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1.87
92012368--92012799
96
4.5
96
98
0
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30
28
8
31
1.87
92016876--92017110
71
3.3
71
100
0
470
19
28
17
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
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28
98
21
28
17
32
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1.9
141
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3
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20
28
17
34
1.95
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1.9
207
100
0
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21
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34
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5
1
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2.2
58
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6
2
41
1.42
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68
2.0
71
80
10
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5
1
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1.34
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2.5
35
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22
20
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1.97
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143
2.1
143
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22
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0
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0
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0
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143
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1.97
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44
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1
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25
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1.8
428
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19
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1.97
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21
2.0
21
90
0
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19
33
14
33
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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65
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2.2
89
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1.97
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133
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1.97
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39
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33
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1.98
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1.98
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1.97
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0
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1.39
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1.98
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1.98
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47
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238
27
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1.97
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1.99
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2
305
25
24
28
21
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92094384--92094467
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1.94
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2.0
25
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1.97
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175
94
0
948
32
18
9
39
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438