Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  96  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27007212--27007256
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2.1
21
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15
17
1.77
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0
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15
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28
1.96
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27
2.5
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4
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34
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1.96
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3.6
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1.83
27010535--27010639
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1.9
54
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40
22
8
27
1.83
27010627--27011461
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1.82
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6
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4
52
44
47
0
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1.34
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2.1
32
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5
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25
2.1
25
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25
9
7
57
1.57
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2.1
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82
13
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57
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2.0
972
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9.6
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13
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23
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19
29
1.98
27034294--27034782
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1.98
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3.8
93
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12
372
23
26
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1.99
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142
2.3
144
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8
326
23
26
20
29
1.99
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2.3
191
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23
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1.98
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5.6
29
89
0
196
26
16
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1.96
27038204--27038362
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1.8
87
84
0
219
27
16
32
23
1.96
27044221--27044387
40
4.2
40
79
2
167
22
26
23
27
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27044237--27044385
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1.9
79
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6
203
21
26
24
27
1.99
27055171--27055353
40
4.6
39
75
8
138
26
24
27
22
2.00
27055214--27055362
80
1.9
80
81
2
183
22
24
30
22
1.99
27056793--27056837
20
2.2
20
96
0
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35
15
17
31
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24
7.0
24
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239
29
23
21
25
1.99
27056892--27057057
47
3.5
48
89
4
239
29
23
21
25
1.99
27056892--27057057
71
2.3
71
89
3
244
29
23
21
25
1.99
27057250--27057313
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2.1
31
90
0
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35
15
23
25
1.94
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6.2
40
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1
385
25
24
28
22
1.99
27070704--27070953
40
6.2
40
90
1
385
25
24
28
22
1.99
27072875--27072940
28
2.4
28
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7
100
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25
9
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1.81
27074423--27074630
67
3.2
64
75
10
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32
17
27
22
1.96
27078183--27078231
25
2.0
25
96
4
91
24
12
16
46
1.81
27080572--27080719
51
2.9
51
87
2
217
29
25
12
32
1.93
27086535--27086716
40
4.6
40
81
2
215
26
22
27
23
1.99
27094497--27094678
40
4.6
40
87
2
251
26
23
27
22
2.00
27096303--27096534
39
5.9
39
88
3
306
22
31
21
24
1.98
27100484--27100658
49
3.5
48
80
6
190
30
27
16
25
1.97
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50
14.6
50
76
2
601
31
25
15
27
1.96
27104012--27104802
201
3.9
201
93
0
1285
31
25
15
27
1.96
27104012--27104899
151
5.9
151
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608
31
25
16
27
1.96
27109892--27110089
71
2.8
70
89
5
276
32
18
28
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27109926--27110089
71
2.3
71
97
0
310
34
18
28
18
1.95
27113266--27113499
51
4.6
51
91
1
353
28
25
14
31
1.95
27116067--27116103
18
2.1
18
100
0
74
51
16
0
32
1.45
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2.5
32
84
6
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55
5
1
38
1.30
27125648--27125699
18
2.8
19
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8
72
48
0
28
23
1.51
27131565--27131732
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4.2
40
83
3
205
26
27
21
24
1.99
27131569--27131732
80
2.0
80
88
0
238
27
26
20
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1.99
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124
1.8
125
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32
24
11
31
1.90
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4.2
40
85
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214
25
28
22
23
1.99
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2.0
40
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7
8
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1.54
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21
2.2
21
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2.1
16
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22
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0
64
0.94
27165107--27165149
22
2.0
22
86
9
61
41
0
6
51
1.29
27166288--27166360
9
7.8
9
77
8
74
60
2
2
34
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27166295--27166370
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4.0
18
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10
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61
2
2
32
1.23
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9
7.9
10
76
12
70
60
2
2
34
1.24
27166280--27166369
38
2.3
39
81
11
105
56
3
4
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1.36
27168855--27168902
19
2.5
20
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3
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47
8
12
31
1.71
27169274--27169303
15
2.0
15
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0
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26
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26
1.93
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40
4.2
40
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21
28
24
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1.99
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40
4.2
40
85
3
225
21
28
24
25
1.99
27208163--27208299
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2.3
60
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25
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19
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1.98
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40
5.1
40
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220
26
27
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24
1.99
27210177--27210358
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24
1.99
27214184--27214219
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0
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1.32
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27
17
28
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1.98
27226336--27226505
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21
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24
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1.99
27234430--27234599
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28
24
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1.99
27238190--27238341
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3.9
39
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1.98
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2.0
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0
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2.0
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44
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0
208
18
18
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3.6
40
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25
22
25
2.00
27258184--27258355
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1.8
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93
0
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29
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21
1.99
27258176--27258351
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3.8
46
79
12
207
28
28
21
21
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27260725--27260808
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16
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73
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15
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11
1.68
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45
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29
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1.98
27263714--27263883
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1.8
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92
0
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21
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0
0
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0
0
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50
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2.0
14
100
0
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14
50
1.78
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
27319304--27319342
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11
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1.41
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0
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1.98
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25
2.00
27349885--27350090
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2.6
80
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3
236
25
23
26
24
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438