Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  29  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
136
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26
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0
150
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3
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0
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30
0
38
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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2.1
132
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1.99
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4.0
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54
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1.07
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2.1
23
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62
60
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23
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0
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1.17
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29
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23
69
63
0
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28
1.23
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15
2.9
15
90
6
65
67
0
6
26
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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38
1.9
37
91
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119
22
23
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2.1
15
100
0
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41
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1.27
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29
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70
25
10
8
56
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
7374569--7374601
11
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0
0
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22
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11
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0
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1.66
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22
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60
6
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16
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2
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2
100
0
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0
0
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1.00
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27
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1.70
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2.0
23
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1.63
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0
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0
0
50
1.00
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1.92
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1.93
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18
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0
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29
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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50
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0
100
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7422571--7422861
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17
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1.95
7422571--7422861
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122
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17
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24
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12
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0
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28
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29
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20
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2.1
15
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57
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3
0
33
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
21
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29
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2.7
26
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0
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0
0
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2.1
61
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0
43
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438