Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  56  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14445845--14446035
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14445845--14446035
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2.3
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28
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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(0-2)
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34
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20
2.5
20
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1
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2.1
23
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73
60
0
4
35
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14581209--14581244
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1.77
14629668--14629723
25
2.3
25
79
11
62
30
3
5
60
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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2
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31
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5
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6
7
52
1.55
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85
6
8
0
0.74
14634252--14634304
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2.2
25
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3
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84
5
9
0
0.76
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72
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16
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0
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1.47
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20.0
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1.96
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1.9
45
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0
147
24
13
25
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
14713775--14713822
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18
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1.31
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24
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1.93
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12
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7
160
35
4
1
57
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
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1.99
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1.99
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1.96
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2.1
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101
23
23
15
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1.99
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20
95
5
111
33
20
10
35
1.86

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433   434   435   436   437   438