Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  216  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66852769--66852820
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15
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7
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23
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26
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3.3
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2.00
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29
20
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1.98
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93
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28
1.98
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20
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2.5
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79
0
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29
1.96
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1.9
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149
25
28
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1.96
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2.0
19
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5
58
16
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22
13
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40
3.6
40
79
10
120
26
15
22
35
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66918188--66918236
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14
2.1
14
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0
51
43
0
10
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30
3.2
30
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97
26
16
28
27
1.97
66923049--66923171
46
2.6
47
86
6
160
30
19
26
23
1.98
66923007--66923171
48
3.5
45
82
6
168
30
18
25
25
1.98
66923191--66923323
49
2.7
50
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29
22
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21
1.99
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30
24
18
26
1.98
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4.2
40
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173
23
26
21
28
1.99
66938255--66938423
40
4.2
40
80
4
173
23
26
21
28
1.99
66941036--66941075
21
2.0
20
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5
53
60
5
30
5
1.40
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18
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1.84
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14
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0
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2.0
34
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20
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28
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1.98
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93
100
0
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21
20
29
29
1.98
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1.97
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30
2.7
29
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6
86
72
1
20
5
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
66989603--66989700
30
3.3
30
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26
27
17
28
1.98
66990599--66990647
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2.3
20
82
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1.74
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2.0
29
92
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45
29
0
24
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27
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11
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15
96
0
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14
24
41
19
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
36
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1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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74
5
7
12
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438