Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  58  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15070492--15070531
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13
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2
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1.28
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1.84
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20
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22
20
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31
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1.9
92
92
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2.0
25
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2.0
101
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1.18
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18
2.5
17
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52
40
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0
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0
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2.4
31
82
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3
0
35
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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1
0
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2.2
19
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29
24
0
46
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5
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26
18
23
1.98
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18
2.1
19
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2
38
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0
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28
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15153267--15153900
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3.0
210
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22
17
28
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10
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0
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2
0
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0
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0
0
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20
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26
1.99
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10
18
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46
3.8
46
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20
28
29
1.98
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1.8
93
91
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281
21
20
29
28
1.98
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53
0
25
0
74
0.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15188592--15188661
3
23.7
3
72
13
56
57
4
0
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1.19
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0
0
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13
0
0
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2.8
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19
20
27
1.96
15197109--15197239
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40
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19
116
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19
20
27
1.97
15198232--15198315
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27.7
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97
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159
32
1
0
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0.99
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0
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59
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9
11
35
1.73
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3.4
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4
0
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1.29
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1.96
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1.89
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22
76
14
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0
34
1
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1
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2
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219
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0
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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18
29
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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43
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438