Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  209  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64741261--64741575
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2.6
118
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2
461
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19
26
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1.99
64750558--64750701
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3.7
39
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227
26
20
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22
1.99
64750559--64750741
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2.3
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262
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22
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1.99
64752724--64753067
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473
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21
27
25
1.99
64752724--64753067
40
8.6
40
87
5
459
25
21
27
25
1.99
64752724--64753067
119
2.9
119
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3
525
25
21
27
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1.99
64756603--64756643
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2.0
20
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29
28
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1.9
93
93
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303
28
28
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1.98
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4.2
40
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26
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23
1.98
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3.6
29
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10
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25
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1.97
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2.7
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28
20
24
1.99
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4.8
43
90
7
338
31
32
22
13
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64809030--64809240
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2.5
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4
336
31
32
22
13
1.93
64809211--64809384
40
4.2
42
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10
142
26
28
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23
1.99
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0
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0
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2.0
229
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1.92
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28
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21
1.99
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100
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1.29
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107
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0
0
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0
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0
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0
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1
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0
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2.2
13
100
0
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46
0
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46
1.30
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1.21
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1.9
31
100
0
120
43
0
8
48
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
64846622--64846678
27
2.1
28
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7
42
1.58
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23
100
0
92
39
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13
34
1.83
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17
2.4
18
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53
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41
1.21
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11
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50
76
0
23
0
0.79
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22
2.5
22
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26
33
26
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1.92
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37
2.1
37
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7
23
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100
0
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50
0
0
50
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21
28
1.99
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160
30
20
22
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1.98
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3.6
39
83
1
155
25
22
28
23
1.99
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40
3.3
39
83
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163
23
25
28
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1.99
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2.2
123
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0
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0
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80
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2
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22
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
80
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2
183
22
30
24
22
1.99
64954392--64954499
40
2.7
38
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128
21
29
25
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29
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32
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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0
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64
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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116
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6
393
20
23
28
27
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438