Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438   

This is table  217  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67130034--67130093
29
2.1
29
90
0
93
43
28
0
28
1.55
67130309--67130348
11
3.6
11
86
0
53
75
5
5
15
1.15
67130306--67130348
21
2.0
22
90
4
70
69
6
4
18
1.29
67131403--67131452
18
2.8
18
87
0
73
58
0
28
14
1.37
67131396--67131477
24
3.4
24
79
0
92
59
0
28
12
1.33
67134020--67134117
30
3.3
30
75
0
97
29
16
26
27
1.97
67136324--67136408
30
2.8
29
83
13
109
14
22
0
63
1.30
67136359--67136414
18
3.1
18
79
5
60
8
19
1
69
1.24
67136384--67136408
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
67136411--67136441
12
2.6
12
94
0
53
29
16
9
45
1.79
67136489--67136545
5
11.0
5
75
20
55
1
17
3
77
1.00
67136489--67136545
16
3.7
14
82
15
60
1
17
3
77
1.00
67136489--67136556
21
3.2
21
76
15
61
1
17
4
76
1.03
67137460--67137511
11
4.7
11
86
13
72
17
5
5
71
1.26
67138983--67139079
30
3.2
30
77
2
106
28
15
26
28
1.96
67141577--67141636
29
2.1
29
93
0
102
41
30
0
28
1.56
67141583--67141630
15
3.3
15
73
5
53
43
27
0
29
1.55
67141960--67142003
20
2.2
20
84
12
54
77
4
18
0
0.94
67142075--67142105
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
67146256--67146343
30
2.9
30
78
9
90
28
17
25
29
1.97
67147039--67147088
10
5.0
10
77
15
50
22
20
20
38
1.94
67147027--67147083
20
2.8
21
79
12
57
21
22
21
35
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67149708--67149755
20
2.3
21
85
3
62
20
27
20
31
1.98
67149717--67149756
21
2.0
20
90
5
62
20
22
25
32
1.98
67155837--67155994
76
2.1
77
93
1
273
26
10
12
50
1.73
67158307--67158345
11
3.4
11
80
13
51
71
7
5
15
1.26
67158306--67158351
13
3.6
13
82
11
60
73
6
6
13
1.22
67158328--67158367
17
2.4
16
84
15
55
77
5
7
10
1.11
67159280--67159336
11
5.5
10
73
22
55
78
0
17
3
0.88
67159280--67159336
5
11.0
5
75
20
55
78
0
17
3
0.88
67159405--67159497
28
3.3
27
77
14
91
67
2
19
10
1.30
67159399--67159453
17
3.1
17
78
5
56
70
3
18
7
1.25
67161593--67161689
30
3.2
30
65
8
72
29
28
13
27
1.94
67167937--67167966
10
2.9
10
95
5
51
20
20
13
46
1.83
67170248--67170433
40
4.7
40
89
5
261
24
21
27
26
1.99
67170248--67170466
80
2.8
80
83
8
270
25
21
26
26
1.99
67173463--67173563
19
5.2
18
71
23
64
4
21
2
70
1.20
67179717--67179804
30
2.9
30
78
6
88
29
23
17
29
1.97
67180446--67180493
20
2.4
20
71
0
51
22
29
16
31
1.96
67186106--67186134
13
2.2
13
100
0
58
62
10
0
27
1.28
67188039--67188116
30
2.6
30
72
8
77
28
25
17
28
1.98
67189831--67189870
10
3.9
10
93
6
71
70
10
2
17
1.27
67189831--67189882
21
2.4
22
90
3
79
69
9
3
17
1.31
67189833--67189882
11
4.5
11
90
7
66
72
8
4
16
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67190802--67190858
5
11.0
5
77
17
55
75
1
19
3
1.04
67190806--67190858
21
2.5
21
78
6
63
75
1
18
3
1.05
67190906--67190936
12
2.6
12
100
0
62
45
12
16
25
1.83
67190939--67190963
12
2.1
12
100
0
50
76
0
16
8
1.02
67190933--67190988
18
3.1
18
76
5
51
69
3
19
7
1.27
67190939--67191020
30
2.7
31
79
5
96
65
1
20
12
1.32
67192779--67192830
26
2.0
26
100
0
104
38
15
7
38
1.76
67193175--67193252
30
2.6
30
72
8
77
28
25
17
28
1.98
67195156--67195203
15
3.3
15
73
5
53
31
0
25
43
1.55
67195150--67195209
29
2.1
29
90
0
93
30
0
28
41
1.56
67198439--67198494
30
1.9
28
85
7
76
12
30
3
53
1.55
67199520--67199554
18
1.9
18
88
11
54
14
5
2
77
1.07
67203849--67203877
13
2.2
13
100
0
58
62
10
0
27
1.28
67204102--67204150
10
4.8
10
80
14
55
40
22
22
14
1.90
67204102--67204150
21
2.4
21
89
3
73
40
22
22
14
1.90
67209882--67209926
14
3.1
14
75
6
54
24
0
31
44
1.54
67209880--67209939
29
2.1
29
90
0
93
26
0
30
43
1.55
67213151--67213206
30
1.9
28
85
7
76
12
30
3
53
1.55
67214267--67214291
9
2.8
9
100
0
50
0
8
8
84
0.79
67214507--67214566
29
2.1
29
93
0
102
28
0
28
43
1.55
67221302--67221341
21
1.9
21
94
0
71
40
17
22
20
1.92
67223415--67223478
30
2.2
29
83
8
76
14
25
1
59
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67223469--67223508
19
2.2
19
90
4
64
0
25
5
70
1.08
67225690--67225729
21
1.9
21
94
0
71
40
17
22
20
1.92
67229258--67229354
30
3.2
30
76
2
106
27
16
27
27
1.97
67231461--67231543
30
2.7
30
81
9
89
13
21
1
63
1.35
67231494--67231549
18
3.1
18
76
5
51
7
19
1
71
1.18
67231519--67231543
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
67231546--67231576
12
2.6
12
100
0
62
25
16
12
45
1.83
67231626--67231686
16
3.9
15
75
14
61
4
14
3
77
1.07
67231624--67231669
15
3.1
14
84
12
56
4
17
2
76
1.06
67231642--67231691
21
2.4
20
83
12
57
2
16
4
78
1.00
67232600--67232638
17
2.3
17
83
12
53
10
7
5
76
1.13
67232617--67232661
12
3.7
12
87
3
63
15
6
4
73
1.21
67238322--67238369
15
3.3
15
73
5
53
43
25
0
31
1.55
67238588--67238626
12
3.0
13
85
11
53
74
5
2
17
1.12
67238595--67238640
21
2.2
21
85
14
60
73
4
4
17
1.15
67239541--67239574
12
2.8
12
90
0
50
50
8
20
20
1.75
67239670--67239725
30
1.9
28
85
7
76
53
3
30
12
1.55
67242966--67243013
15
3.3
15
73
5
53
43
25
0
31
1.55
67243829--67243857
13
2.2
13
100
0
58
62
10
0
27
1.28
67245321--67245392
30
2.4
31
79
11
78
15
23
1
59
1.44
67245484--67245540
5
11.0
5
75
20
55
3
17
1
77
1.00
67245484--67245540
16
3.7
14
82
15
60
3
17
1
77
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67245484--67245551
21
3.2
21
76
15
61
2
17
2
76
1.04
67246468--67246514
12
3.7
12
85
8
58
14
6
6
72
1.25
67251445--67251487
22
2.0
22
81
9
52
69
4
11
13
1.33
67252366--67252430
33
1.9
35
87
12
100
70
3
20
6
1.22
67252401--67252479
6
12.8
6
71
10
61
72
1
20
6
1.14
67252427--67252539
42
2.7
41
75
5
118
61
2
25
10
1.42
67254026--67254059
10
3.4
10
83
0
50
17
26
17
38
1.92
67254240--67254284
19
2.3
19
80
3
54
26
2
15
55
1.52
67258399--67258455
5
11.0
5
75
20
55
3
17
1
77
1.00
67258399--67258455
16
3.7
14
82
15
60
3
17
1
77
1.00
67258397--67258466
20
3.3
20
73
18
63
4
18
1
75
1.04
67259368--67259409
11
3.9
11
81
6
59
14
7
4
73
1.21
67259667--67259714
14
3.4
14
85
0
60
43
6
31
18
1.75
67268256--67268303
20
2.4
20
93
6
80
20
0
10
68
1.18
67268256--67268303
10
4.8
10
85
10
71
20
0
10
68
1.18
67269474--67269596
50
2.4
50
84
2
165
38
13
13
34
1.85
67269613--67269689
39
2.0
39
97
0
145
48
15
6
29
1.70
67269616--67269698
39
2.1
39
91
4
132
50
14
6
28
1.66
67272941--67273004
25
2.5
26
79
18
73
7
26
3
62
1.38
67276328--67276354
10
2.7
10
100
0
54
40
29
11
18
1.85
67282147--67282243
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
67284432--67284514
30
2.7
30
81
9
89
13
21
1
63
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
67284465--67284520
18
3.1
18
76
5
51
7
19
3
69
1.27
67284490--67284514
12
2.1
12
100
0
50
8
16
0
76
1.02
67284580--67284636
5
11.0
5
78
17
55
1
17
0
80
0.79
67284582--67284636
16
3.5
15
87
5
74
1
16
0
81
0.77
67284593--67284636
6
8.2
6
80
19
53
0
18
0
81
0.68
67284580--67284647
21
3.2
20
83
8
82
2
17
0
79
0.86
67284584--67284632
25
1.9
25
87
4
71
2
16
0
81
0.78
67286738--67286823
30
2.9
30
78
3
102
30
27
15
26
1.96
67289411--67289508
47
2.1
47
96
0
178
35
23
17
23
1.95
67291071--67291167
30
3.2
30
77
2
106
28
26
15
28
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
          369   370   371   372   373   374   375   376   377   378   379   380   381   382   383   384   
          385   386   387   388   389   390   391   392   393   394   395   396   397   398   399   400   
          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438