Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  407  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126543930--126543962
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2
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0
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0
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0
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32
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64
0
2
32
1.08
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28
2.9
29
84
10
100
65
0
4
30
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126621562--126621654
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38
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3
100
0
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0
31
0
68
0.89
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20
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2
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0
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19
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0
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1.14
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0
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31
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0
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36
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53
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0
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1
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1.20
126626933--126627021
27
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28
100
0
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18
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2.0
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51
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1.93
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152
34
13
24
27
1.93
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0
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126701226--126701251
5
5.2
5
100
0
52
38
19
19
23
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
126701200--126701251
26
2.0
26
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15
26
23
1.94
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1.9
215
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2.2
30
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0
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5
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1.45
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13.3
6
87
0
97
17
5
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1.10
126709529--126709622
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5.3
18
83
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102
18
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22
17
25
1.96
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27
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0
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12
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0
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20
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16
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24
2.2
24
96
0
95
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19
21
28
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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27
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1.97
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2.8
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214
29
27
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1.97
126796410--126796484
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0
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21
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1.66
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19
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177
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18
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1
0
57
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.89
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2.0
55
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0
175
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20
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
101
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1.8
147
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1.86
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1.98
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5
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1.46
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2
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1.12
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3.1
41
87
6
177
18
22
21
37
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438