Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  300  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93904183--93904438
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1.8
139
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0
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1.92
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3.3
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17
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13
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1.94
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0
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22
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2.00
93907885--93908344
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1
798
24
25
22
26
2.00
93907885--93908344
159
2.9
160
95
0
816
24
25
22
26
2.00
93910620--93910759
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46
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28
8
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6.1
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11
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1.92
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0
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0
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2.3
136
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2
452
28
22
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40
1.84
93915353--93915665
27
11.6
27
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4
371
28
22
8
40
1.84
93915334--93915729
54
7.3
54
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4
199
30
22
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37
1.85
93916903--93916950
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2.0
24
83
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60
31
25
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1.98
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24
7.0
24
88
4
232
28
23
21
26
1.99
93917062--93917229
47
3.5
48
88
4
234
29
23
21
26
1.99
93917062--93917228
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2.3
71
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264
28
23
21
26
1.99
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27
11.6
27
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387
28
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1.84
93921853--93921900
25
2.0
24
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4
60
31
25
18
25
1.98
93922012--93922178
24
7.0
24
88
4
232
28
23
21
26
1.99
93922012--93922179
47
3.5
48
88
4
234
29
23
21
26
1.99
93922012--93922178
71
2.3
71
91
3
264
28
23
21
26
1.99
93923814--93923855
21
2.0
21
86
4
59
35
2
14
47
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93924405--93924451
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2.0
25
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93924712--93924893
46
4.0
46
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1
222
20
23
14
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1.89
93926963--93927035
31
2.3
32
84
11
89
54
2
1
41
1.23
93929618--93929664
25
2.0
25
83
8
62
27
14
4
53
1.60
93929925--93930188
46
6.0
45
85
8
330
21
24
14
38
1.92
93930102--93930178
38
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0.90
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16
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22
1.14
93936021--93936062
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1.98
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2.2
12
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0
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0
0
50
1.00
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28
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23
3.6
23
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225
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21
30
22
1.99
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24
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29
23
1.99
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234
26
20
30
22
1.99
93953313--93953494
77
2.3
79
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269
24
22
29
23
1.99
93959390--93959662
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280
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27
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1.98
93959390--93959661
96
2.8
96
88
2
375
25
27
18
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93959388--93959662
144
1.9
145
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340
25
27
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29
1.98
93967053--93967285
48
4.8
48
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4
236
26
26
17
29
1.97
93967053--93967285
96
2.4
97
85
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290
26
26
17
29
1.97
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0
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0
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0
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31
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30
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3
6
50
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75
81
11
184
40
1
19
37
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
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28
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0
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24
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1.99
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1.99
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1.99
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1.99
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1.84
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1.95
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15
22
30
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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20
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26
27
21
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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27
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1.99
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27
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1.98
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0
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0
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          433   434   435   436   437   438