Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  122  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35944545--35944713
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25
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3.0
30
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1.65
35957094--35957173
15
5.4
15
80
7
92
58
13
17
10
1.62
35957105--35957182
15
5.2
15
78
9
79
56
15
16
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1.67
35960069--35960240
93
1.8
93
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29
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21
1.99
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223
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28
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21
1.98
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1.97
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4.4
45
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10
164
22
28
20
28
1.98
35962239--35962409
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3.7
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13
179
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29
19
28
1.98
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9
211
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0
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11
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0
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2.0
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2.3
26
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70
25
23
21
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1.99
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4.3
20
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19
11
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1.88
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9
9.4
10
73
17
72
34
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10
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1.86
35988654--35988752
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3.8
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23
24
27
2.00
35988802--35988868
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3.3
20
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4
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19
8
35
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
35988802--35988859
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35988810--35988866
9
5.8
10
80
15
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35
1.76
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0
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2.2
30
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32
6
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43
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23
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19
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1.99
36002601--36002721
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2.6
46
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2
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25
28
16
28
1.97
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2.0
20
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20
0
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1.52
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26
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3
125
34
2
22
40
1.67
36013306--36013348
12
3.6
12
93
0
77
16
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1.73
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2.1
32
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0
123
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22
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0
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33
0
0
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0.92
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0
0
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0.91
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18
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0
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1.03
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51
30
0
7
61
1.24
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1.9
93
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17
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1.93
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2
14.5
2
100
0
58
48
0
0
51
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
36026228--36026269
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0
0
54
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20
30
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1.98
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93
1.8
93
93
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297
20
20
30
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1.98
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31
2.3
27
80
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12
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1.67
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0
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1.90
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56
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24
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2.1
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22
22
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1.98
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27
2.1
27
90
0
87
29
33
14
22
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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23
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78
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1.98
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
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40
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
48
1.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438