Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438   

This is table  81  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
21990233--21990282
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2.0
25
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0
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28
2
0
70
0.99
21990237--21990276
17
2.4
17
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4
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27
2
0
70
1.01
21990226--21990301
20
3.6
20
72
19
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27
2
1
68
1.11
21990226--21990323
9
10.7
9
69
18
60
27
3
1
68
1.11
21990237--21990331
19
5.2
19
71
22
62
26
5
1
67
1.18
21990817--21990863
24
2.0
24
87
8
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51
2
4
42
1.33
21993576--21993636
28
2.2
28
88
2
88
31
3
6
59
1.39
21993975--21994027
19
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18
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10
56
58
3
0
37
1.16
21993975--21994027
18
2.9
18
83
5
63
58
3
0
37
1.16
21993992--21994041
25
2.1
23
85
7
64
56
2
0
42
1.11
21993994--21994077
8
9.6
8
75
12
51
60
2
3
33
1.27
21994413--21994494
42
2.0
42
97
0
155
41
1
2
54
1.21
21994413--21994471
2
31.5
2
80
13
54
44
0
1
54
1.10
21995044--21995110
30
2.2
31
78
10
75
53
1
4
40
1.30
22002706--22002803
28
3.5
28
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4
108
29
16
24
29
1.96
22010326--22010423
28
3.5
28
84
4
108
29
16
24
29
1.96
22012917--22013416
39
12.6
40
85
4
669
24
20
29
26
1.99
22012917--22013414
79
6.3
79
93
2
806
24
20
28
26
1.99
22021277--22021619
40
8.6
40
85
5
439
24
21
27
25
1.99
22021311--22021652
158
2.2
156
87
6
499
26
20
27
25
1.99
22021277--22021613
79
4.2
79
92
3
509
24
21
28
25
1.99
22026487--22026519
9
3.7
9
91
0
57
27
9
21
42
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22027756--22027907
41
3.7
40
82
3
169
32
17
22
26
1.96
22027756--22027907
82
1.9
82
81
5
191
32
17
22
26
1.96
22027841--22027975
68
2.0
68
86
0
189
28
20
21
29
1.98
22027909--22028104
41
4.8
41
81
3
207
28
20
23
27
1.99
22027807--22028016
109
1.9
109
80
3
244
29
18
24
28
1.98
22027766--22028053
150
1.9
150
87
1
416
30
18
22
28
1.98
22027909--22028106
82
2.4
82
88
0
297
27
20
24
27
1.99
22027911--22028146
41
5.8
41
80
4
172
27
20
24
27
1.99
22027909--22028145
82
2.9
82
83
2
253
27
20
24
27
1.99
22027913--22028146
123
1.9
123
80
3
274
27
19
24
28
1.99
22028767--22028861
41
2.3
42
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3
122
37
17
24
20
1.93
22028883--22029021
7
19.4
7
71
14
70
23
1
25
50
1.58
22029062--22029104
22
2.0
22
86
9
61
20
0
39
39
1.53
22029286--22029326
21
2.0
21
85
9
57
21
4
26
46
1.72
22030292--22030339
18
2.7
17
75
9
51
31
31
0
37
1.58
22032898--22032923
13
2.0
13
100
0
52
53
0
7
38
1.30
22032933--22033030
9
11.1
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79
6
94
45
18
1
34
1.56
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42
6.7
42
86
4
385
25
17
26
30
1.98
22038984--22039266
86
3.3
85
87
2
399
25
18
26
29
1.98
22039279--22039462
42
4.3
42
88
2
226
25
18
24
31
1.97
22039279--22039462
85
2.2
85
86
3
246
25
18
24
31
1.97
22039085--22039498
196
2.1
195
86
4
564
27
18
23
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22039472--22039758
143
2.0
143
99
0
565
26
20
20
33
1.97
22045587--22045623
13
2.8
13
91
0
56
0
27
0
72
0.84
22048267--22048336
15
4.4
15
74
12
59
61
0
1
37
1.05
22053329--22053374
22
2.0
22
87
8
65
52
6
17
23
1.68
22055667--22055709
21
2.0
21
100
0
86
23
0
9
67
1.19
22055927--22055963
17
2.2
17
95
0
65
75
0
8
16
1.02
22056001--22056672
152
4.5
151
93
1
1109
58
7
6
27
1.51
22056001--22056672
303
2.2
300
92
2
1107
58
7
6
27
1.51
22062645--22062681
16
2.3
16
100
0
74
16
29
13
40
1.86
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39
3.5
39
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173
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12
4
32
1.58
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1.9
16
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64
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1.24
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2.2
22
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2
25
0
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0.96
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25
1.9
26
88
12
75
2
26
0
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0.97
22063405--22063466
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19
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1
32
16
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28
18
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1.95
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2.3
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0
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17
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1
0
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1.10
22087948--22087995
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14
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2
33
1.41
22095458--22095587
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
22103429--22103558
40
3.2
40
84
4
174
22
24
29
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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10
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0
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0
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2
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1.96
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28
2.0
28
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0
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42
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46
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1.98
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27
2.0
26
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2.3
26
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2
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21
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20
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1.95
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24
25
2.00
22140284--22140490
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2.00
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14
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3.9
46
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9
215
21
22
29
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22156050--22156220
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93
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22
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70
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19
31
1.94
22162928--22163726
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2
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19
31
1.94
22162928--22163704
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2.7
290
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2
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1.94
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2.00
22208664--22208846
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1.99
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2.3
20
84
0
56
15
39
10
34
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
22217425--22217465
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1.9
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1.98
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1.93
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1.99
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1.98
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4.9
47
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0
383
26
29
11
32
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438