Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  423  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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2.0
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6
0
30
1.19
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2.4
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4
0
63
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2.0
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216
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1440
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46
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3.0
26
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0
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40
22
5
32
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131027576--131027907
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404
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18
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1.9
21
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12
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1.65
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0
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50
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0
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80
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0
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1.20
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2.0
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1.11
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19
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6
4.2
6
100
0
50
16
16
16
52
1.76
131065938--131066220
18
15.3
18
71
12
162
35
11
15
37
1.84
131065938--131066220
36
7.6
36
69
13
189
35
11
15
37
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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3
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29
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21
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65
2
0
32
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0
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0
0
50
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34
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131081868--131081950
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0
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0
0
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2.3
42
90
0
149
23
21
22
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
22
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219
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1
1211
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21
20
33
1.97
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2
6
29
1.33
131108845--131108901
18
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17
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1.12
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15
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0
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2.0
137
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1.98
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0
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11
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1.66
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2.2
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90
0
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2.0
83
92
3
282
48
13
4
33
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
131170749--131170793
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0
0
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1.10
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1.8
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82
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5
5
36
1.46
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0
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4
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0
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3.1
41
60
28
98
32
17
28
21
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          433   434   435   436   437   438