Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  369  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114943707--114943910
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0
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119
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1.94
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4.0
23
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15
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5
37
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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17
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1.66
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1.9
25
83
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60
4
0
35
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115079646--115079727
11
7.5
11
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53
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8
1.64
115079637--115079695
22
2.7
23
79
10
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55
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8
10
1.61
115079933--115079981
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9
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1.75
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2.2
18
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1.71
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20
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1.64
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84
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66
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26
18
27
1.98
115132035--115132101
18
3.6
18
67
25
57
32
11
20
34
1.90
115132028--115132111
39
2.1
40
95
2
152
36
9
20
33
1.85
115134240--115134350
21
5.3
21
74
4
91
43
21
23
11
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115134255--115134412
42
3.7
42
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0
190
45
18
21
14
1.85
115136259--115136522
69
3.8
69
80
2
296
36
21
23
18
1.95
115136240--115136503
138
1.9
138
85
1
359
37
21
23
17
1.94
115136232--115136525
138
2.1
138
82
2
358
36
21
24
18
1.94
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40
6.2
40
91
1
385
22
28
24
25
1.99
115146320--115146566
40
6.2
40
89
3
358
22
28
24
25
1.99
115154487--115154697
40
5.2
40
87
3
298
21
28
24
25
1.99
115162613--115162860
40
6.2
40
91
3
385
21
29
23
25
1.99
115170808--115170890
14
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59
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0
6
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115170814--115170930
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73
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4
1.19
115171404--115171478
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1.9
39
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33
6
5
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1.49
115171578--115171620
16
2.6
16
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39
6
6
46
1.58
115171673--115171774
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2.6
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4
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1.41
115173458--115173493
12
3.0
12
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0
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5
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1.73
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2.0
124
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3
392
24
13
22
39
1.90
115180229--115180821
263
2.3
257
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2
1033
25
14
22
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1.93
115180659--115180824
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2.3
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22
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21
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1.89
115181049--115181193
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1.9
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18
22
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1.97
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2.9
166
89
4
684
29
18
20
31
1.96
115181226--115181590
72
4.8
73
79
7
383
30
16
19
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115181528--115181651
61
2.0
61
85
3
169
29
18
23
29
1.98
115181687--115181748
30
2.1
30
90
6
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19
9
29
41
1.83
115182561--115182595
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2.2
16
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5
54
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2
8
0
0.61
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16
2.3
16
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4
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0
5
1.19
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2.7
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2
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1.36
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2
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0
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0
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6
29
1.65
115189091--115189412
158
2.0
159
88
5
483
50
12
6
29
1.65
115193563--115193606
5
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0
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0
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1.34
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0
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0
0
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0
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1.09
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2
106
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0
4
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0
0
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1.00
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0
0
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0.99
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1790
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14
14
34
1.87
115203529--115203567
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1.9
20
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15
25
35
23
1.94
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2.1
29
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20
5
0
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1.00
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7.1
94
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3
691
35
16
20
27
1.94
115213217--115213887
188
3.6
185
82
3
765
35
16
20
27
1.94
115213476--115213625
44
3.3
44
70
17
133
36
18
18
26
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115213497--115213641
50
3.0
50
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19
126
35
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18
28
1.94
115214996--115215031
18
2.1
17
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54
8
44
27
19
1.79
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0
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0
10
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0
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0
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1.55
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2.0
23
100
0
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13
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16
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0
92
29
29
7
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1.84
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4.4
41
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1.95
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1
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1.95
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5.2
26
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0
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1.83
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8
3.8
8
90
0
51
43
26
26
3
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438