Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  44  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11040982--11041012
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14
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0
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2
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2.2
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2.7
70
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11
23
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1.90
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1.9
105
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276
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125
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2
345
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17
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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74
22
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43
0
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1.10
11068499--11068554
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81
16
69
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1
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19
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18
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0
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2.1
26
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50
1
1
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1.23
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2.0
23
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25
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11
1.51
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3.3
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18
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30
5
4
59
1.40
11097877--11097938
22
2.9
21
77
15
65
32
6
3
58
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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13
100
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21
2.5
20
80
3
55
16
30
26
28
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
0
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1.00
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11151044--11151152
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0
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2.0
26
82
7
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20
15
28
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.2
24
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1.83
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4.2
19
87
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117
35
16
8
39
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11272923--11273052
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0
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1.83
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2.8
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81
11
126
22
18
19
39
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438