Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  432  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133090711--133091073
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133090711--133091075
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76
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29
17
18
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1.94
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1.8
88
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1.94
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2.1
30
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25
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1.00
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2.2
22
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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10
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20
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0
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3.0
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2.1
31
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94
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7
12
43
1.71
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133190985--133191050
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2.1
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1.8
206
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19
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75
2.4
73
83
8
217
33
23
11
31
1.90
133273311--133273477
35
4.6
35
86
7
192
33
23
10
31
1.89
133280810--133280977
35
4.6
35
85
7
185
33
23
10
32
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133280805--133280977
75
2.4
73
83
9
210
33
23
10
32
1.89
133284750--133285161
44
9.6
44
69
12
273
36
20
23
20
1.95
133284745--133285170
86
5.0
86
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2
635
36
20
23
20
1.95
133290294--133290356
31
2.0
31
96
0
117
34
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6
44
1.70
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2.0
55
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1
206
22
21
18
37
1.94
133291351--133291408
30
1.9
30
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24
25
1.83
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2
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2
100
0
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0
0
48
1.00
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2.0
39
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0
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5
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24
2.3
24
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0
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0
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1.27
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44
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0
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22
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15
29
1.95
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2.5
19
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0
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20
20
1.90
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2.1
12
100
0
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8
28
1.57
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39
2.0
39
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0
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24
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1.76
133308276--133308306
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1.9
16
100
0
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6
19
19
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1.65
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2.3
28
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57
1
0
40
1.08
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2.4
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31
0
0
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0.90
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2.0
21
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34
0
0
65
0.93
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19
2.1
19
100
0
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5
5
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1.41
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19
2.2
19
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0
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40
4
7
47
1.52
133314865--133314950
3
28.3
3
74
17
72
66
1
2
30
1.12
133314861--133314950
18
4.7
18
80
13
92
65
1
2
31
1.12
133314865--133314951
27
3.4
27
74
19
87
66
1
2
29
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133315286--133315369
23
3.5
25
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63
28
1
7
1.28
133315517--133315547
4
7.8
4
100
0
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22
0
0
77
0.77
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44
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25
23
19
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1.98
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132
4.4
132
94
0
1018
25
23
19
32
1.98
133316008--133316405
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4.5
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11
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25
23
19
31
1.98
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2.9
68
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3
296
27
22
23
27
1.99
133316733--133317622
43
20.4
43
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20
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22
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131
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20
21
22
35
1.96
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260
3.3
260
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2
1325
20
21
22
35
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1.9
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96
0
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0
2
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0
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24
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4
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1.40
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28.3
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73
19
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65
1
3
30
1.17
133324675--133324757
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12
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1
3
30
1.17
133324680--133324760
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4.4
18
79
13
76
65
1
3
29
1.17
133324675--133324761
27
3.4
27
71
19
78
65
1
3
29
1.16
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20
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5
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25
0
5
1.09
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22
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7
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60
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1
9
1.36
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0
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0
0
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0.76
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2.7
13
86
0
52
34
2
2
60
1.26
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
133343634--133343682
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2.0
25
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48
20
4
26
1.67
133345500--133345561
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2.8
23
82
9
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11
0
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1.40
133345461--133345561
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1
43
1.56
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2.9
303
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11
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100
0
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4
9
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1.53
133353246--133353381
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8
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0
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24
1.9
26
84
16
66
58
6
0
35
1.23

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   363   364   365   366   367   368   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438