Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  2  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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(0-2)
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2.0
68
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1.8
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28
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18
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59
0
0
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3
79
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1
29
2
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
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(0-2)
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0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
0
46
1.00
601116--601167
22
2.3
23
86
6
70
53
1
0
44
1.11
601154--601192
19
2.0
20
85
5
53
38
5
0
56
1.22
605999--606651
210
3.1
210
90
2
990
32
18
19
29
1.96
606519--606763
135
1.8
135
91
0
409
34
16
17
31
1.93
606309--606996
345
2.0
345
88
1
1038
32
18
19
29
1.96
606654--607852
210
5.7
210
92
0
1914
32
19
18
29
1.96
606099--607206
555
2.0
555
89
1
1684
32
18
19
29
1.95
622369--622535
35
4.6
35
82
8
183
31
10
24
33
1.90
622369--622539
75
2.4
75
83
7
203
31
11
23
33
1.90
627670--628432
210
3.7
205
82
7
822
34
16
18
29
1.94
627794--628435
210
3.1
207
83
6
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34
17
18
29
1.94
628303--628547
135
1.8
135
93
0
427
37
15
16
30
1.90
628113--628780
345
1.9
345
89
1
1034
35
17
18
28
1.93
628438--629636
210
5.7
210
91
0
1880
32
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18
29
1.96
627883--628986
555
2.0
555
87
2
1581
34
17
18
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2.0
31
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0
95
32
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1.66
636126--636169
20
2.2
20
100
0
88
20
4
25
50
1.67
641411--641458
19
2.6
19
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3
62
35
2
12
50
1.52
641475--641563
42
2.1
42
91
0
142
28
6
14
50
1.68
645362--645409
19
2.6
19
86
3
71
35
2
14
47
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
645426--645514
42
2.1
42
91
0
142
28
6
15
49
1.70
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22
2.2
23
82
17
59
36
0
0
63
0.95
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28
2.0
28
86
10
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36
7
5
50
1.53
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33
1.9
34
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9
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26
10
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2.3
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0
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39
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149
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8
14
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1.67
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2.1
15
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0
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0
45
1.36
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2.0
13
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0
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0
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1.14
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2.0
23
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12
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0
0
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5
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2
0
77
0.88
686196--686281
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7
122
20
2
0
76
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687231--687460
117
2.0
117
92
0
388
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17
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2.0
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6
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0
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12
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0
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50
0
19
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1.48
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2.0
22
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4
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36
15
25
22
1.94
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4
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4
100
0
52
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0
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1.50
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120
2.0
116
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3
381
36
25
9
28
1.88
718311--718350
3
13.3
3
100
0
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0
35
0
0.93
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2.0
24
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0
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41
14
8
35
1.76
718685--718764
31
2.6
31
82
11
101
53
6
18
21
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
733202--733382
50
3.6
50
78
10
192
25
18
26
29
1.98
733256--733392
51
2.7
50
82
5
154
25
17
26
30
1.97
733205--733389
101
1.9
100
84
5
241
25
18
25
30
1.98
733480--733531
27
2.0
26
81
11
61
38
1
23
36
1.66
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20
2.0
20
90
4
66
14
2
0
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0.75
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2.0
15
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6
51
13
0
0
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0.58
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2.4
44
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28
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2.0
15
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51
13
0
0
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2.6
20
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15
7
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1.41
752024--752048
13
1.9
13
100
0
50
48
8
8
36
1.62

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438