Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  248  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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2
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20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
76806584--76806652
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
76817484--76817521
20
1.9
20
88
0
58
34
2
10
52
1.50
76819148--76819216
28
2.5
28
95
2
122
43
27
10
18
1.82
76820579--76820638
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41
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39
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102
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1.74
76838873--76838975
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1.97
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1.83
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27
4.3
27
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2
124
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24
1.96
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21
2.9
21
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4
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37
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19
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1.87
76843547--76843599
11
5.0
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2.4
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16
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2.5
33
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0
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20
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24
1.99
76852730--76852791
31
2.0
32
87
3
90
35
19
24
20
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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35
1.94
76859309--76859506
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
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70
2.3
71
97
2
310
19
28
17
35
1.94
76866314--76866509
70
2.8
69
90
4
245
20
28
16
33
1.95
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1.98
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0
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1.98
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26
25
19
29
1.98
76899302--76899344
8
5.4
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0
50
9
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76899302--76899344
16
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16
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23
18
48
1.76
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18
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1.91
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23
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1.86
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54
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232
20
21
20
37
1.94
76907199--76907379
81
2.2
81
89
0
272
20
20
20
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1.94
76907199--76907379
27
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27
84
0
209
20
20
20
38
1.94
76913730--76913893
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
76913730--76913927
71
2.8
70
91
3
258
20
28
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33
1.95
76921305--76921468
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
76921305--76921502
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
76932560--76932729
93
1.8
92
87
6
254
28
18
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25
1.98
76940003--76940134
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162
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19
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25
1.98
76953155--76953298
40
3.6
40
83
4
159
27
26
19
27
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
76953173--76953331
40
4.0
40
81
1
131
27
27
19
25
1.99
76958019--76958109
29
3.2
29
76
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89
30
31
10
26
1.91
76958324--76958358
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2.2
16
89
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17
17
11
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24
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231
25
22
26
26
2.00
76974272--76974492
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2.8
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270
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22
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25
2.00
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1.99
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25
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1.89
77000603--77000658
28
2.0
28
100
0
112
35
17
7
39
1.78
77001581--77001714
42
3.2
41
79
9
146
31
30
16
21
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77001553--77001702
43
3.5
42
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4
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29
30
18
22
1.97
77001553--77001714
86
1.9
85
86
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229
30
29
17
22
1.97
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2.1
67
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5
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30
21
26
20
1.98
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27
6.3
27
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4
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27
20
15
36
1.93
77004555--77004723
53
3.2
53
83
4
207
27
20
15
36
1.93
77011964--77012123
67
2.3
67
83
6
185
30
22
28
19
1.98
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11
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20
55
21
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10
31
1.87
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19
2.7
19
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23
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1.89
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1.94
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0
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1.96
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1.98
77015107--77015227
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2.1
57
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26
28
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1.97
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23
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1.97
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1.98
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1.97
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1.82
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27
1.98
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2.1
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1.89
77037182--77037329
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3.7
40
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1.92
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210
25
30
22
21
1.99
77049362--77049539
79
2.2
79
84
8
220
25
29
23
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77049362--77049539
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4.5
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25
29
23
22
1.99
77057441--77057619
41
4.5
40
86
7
215
25
29
22
22
1.99
77057467--77057619
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1.9
80
86
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220
26
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22
20
1.99
77061748--77061919
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1.8
93
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2
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29
29
19
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1.98
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1.98
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1.99
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1.97
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29
20
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1.98
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30
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1.65
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10
1.62
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1.67
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1.99
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1.97
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1.98
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2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
77094298--77094495
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
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70
2.3
71
97
2
310
19
28
17
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1.95
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71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
77107236--77107433
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
77114349--77114512
71
2.3
71
100
0
328
18
28
17
35
1.94
77114349--77114546
71
2.8
70
91
3
258
20
28
17
33
1.95
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13
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0
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0.90
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30
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1.96
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27
20
22
1.98
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0
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1.97
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1.9
58
88
1
166
30
17
25
26
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438