Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  68  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17721029--17721069
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13
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4
0
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1.02
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0
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1.00
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0
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18
29
29
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0
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0
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14
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0
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0
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25
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3.3
34
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3.5
45
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5
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22
19
15
42
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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18
13
44
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31
2.1
31
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0
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23
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24
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2
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22
22
30
1.99
17827920--17828019
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2.1
48
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1
157
26
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22
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20
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20
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29
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20
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1.54
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1.9
74
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100
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40
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1.72
17854895--17854939
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2.0
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10
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1.84
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1.98
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210
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20
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1.99
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2.0
18
100
0
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22
0
22
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1.89
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9
3.3
9
95
0
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10
13
0
76
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
17878055--17878113
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2.0
29
100
0
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30
30
1.83
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4.9
48
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28
26
19
25
1.99
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11
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1
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1.04
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2.0
50
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17
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1.96
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33
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17
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1.87
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141
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8
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1.54
17901947--17902695
283
2.6
284
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1130
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8
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0
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2.1
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1.57
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17903442--17903523
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35
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1.02
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1
35
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73
27
1
2
68
1.11
17913670--17913905
40
5.9
40
79
5
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30
21
14
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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80
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33
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16
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2.0
20
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0
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28
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28
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1.9
13
100
0
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4
24
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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137
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1.93
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3.8
40
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0
230
27
29
23
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18050743--18050855
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38
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1.86
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3.0
27
80
8
103
29
13
23
34
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438