Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  324  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101420875--101421395
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29
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2.3
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100
0
328
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
Indels
Score
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23
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1.99
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18
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29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
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Consensus
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Score
A
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Entropy
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21
23
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29
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27
15
30
27
1.96
101594535--101594659
56
2.2
56
77
1
126
28
26
28
16
1.97
101595130--101595176
23
2.0
23
84
8
60
23
27
8
40
1.83
101598949--101598982
16
2.1
17
88
5
52
52
14
14
17
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101599767--101599831
28
2.3
29
86
2
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29
32
13
24
1.94
101604680--101604828
40
3.7
40
90
3
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24
27
23
24
2.00
101604648--101604824
80
2.2
80
87
3
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24
26
23
25
2.00
101606411--101606513
29
3.6
27
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5
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29
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16
21
1.95
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29
3.6
27
81
5
98
29
33
16
21
1.95
101647254--101647366
42
2.7
43
79
6
115
24
17
23
33
1.96
101650440--101650510
33
2.2
33
84
5
90
36
23
16
22
1.94
101650485--101650537
27
2.0
27
85
7
72
33
26
22
16
1.96
101655602--101655714
39
2.9
39
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1
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22
21
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23
1.98
101655591--101655744
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1.9
79
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2
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22
21
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1.98
101657955--101658031
28
2.8
28
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4
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24
32
16
25
1.96
101657987--101658056
28
2.5
28
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4
79
28
30
15
25
1.96
101658025--101658130
53
2.0
53
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0
203
26
29
13
31
1.94
101658044--101658138
29
3.4
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19
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26
27
15
30
1.96
101661277--101661439
47
3.5
47
76
11
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22
18
30
29
1.97
101661226--101661493
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22
19
29
29
1.98
101661222--101661485
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2.8
93
94
0
458
21
20
29
28
1.98
101666827--101667090
46
5.7
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12
232
22
19
29
28
1.98
101666819--101667082
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2.8
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93
1
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22
20
29
27
1.99
101674350--101674511
86
1.9
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85
8
222
24
18
23
33
1.96
101674363--101674511
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3.5
42
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158
25
20
23
30
1.98
101692312--101692341
15
2.1
15
93
6
53
30
6
26
36
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101694259--101694387
43
3.1
42
84
7
154
28
19
27
24
1.98
101694277--101694466
41
4.6
41
79
5
170
27
18
29
24
1.98
101699651--101699841
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2.3
84
92
0
319
23
16
25
35
1.95
101710922--101710986
29
2.2
29
100
0
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27
26
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43
1.70
101715960--101716089
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3.3
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4
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23
25
28
23
1.99
101724028--101724157
40
3.3
39
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4
163
23
25
28
23
1.99
101730584--101730894
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2.0
154
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0
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1.75
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0
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1.00
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24
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0
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1.02
101733231--101733277
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0
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1.33
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179
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1.26
101733364--101733414
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4.5
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0
0
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0.97
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3.1
22
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0
2
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1.13
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22
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1
0
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1.09
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14
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44
1
0
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1.08
101733757--101733800
23
2.0
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0
0
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1.00
101733748--101733904
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20
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24
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52
2
0
43
1.19
101733803--101733844
21
2.0
21
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59
4
0
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1.19
101733773--101733860
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3
0
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101733831--101733911
23
3.6
22
83
12
103
51
2
1
44
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101733831--101733922
44
2.1
44
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11
118
54
2
2
41
1.25
101734949--101734987
18
2.2
19
86
9
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61
10
17
10
1.55
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17
2.1
17
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0
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40
17
2
40
1.64
101735930--101735961
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2.5
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15
0
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7
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1.31
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13
2.8
14
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16
51
27
25
0
47
1.52
101743174--101743214
18
2.2
19
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0
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1.94
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4.1
21
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18
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2.2
13
100
0
56
0
14
7
78
0.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438