Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  12  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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21
1.68
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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20
33
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3423519--3423577
27
2.2
27
81
6
66
42
5
3
49
1.41
3427380--3427413
16
2.1
17
88
5
52
41
2
2
52
1.31
3429123--3429187
31
2.1
31
100
0
130
15
6
9
69
1.35
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16
1.9
16
93
0
53
6
12
19
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1.53
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27
2.1
27
100
0
112
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3
28
21
1.68
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27
2.6
28
77
11
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42
7
5
44
1.55
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12
2.2
12
100
0
54
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0
0
48
1.00
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2.0
36
100
0
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16
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2.4
20
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50
0
1
47
1.12
3452303--3452353
25
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25
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0
102
27
19
11
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1.86
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21
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21
95
0
79
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136
2.1
136
98
0
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25
18
24
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21
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21
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2
12
1.51
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25
5.2
25
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9
196
37
22
4
35
1.75
3458918--3459047
49
2.6
51
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11
198
37
22
4
35
1.75
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12
3.6
12
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0
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1.71
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136
2.1
136
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26
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2.0
33
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2.0
27
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0
110
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7
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20
2.2
21
84
7
58
28
4
0
67
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.1
18
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1
0
37
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2.2
47
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1
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13
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1.92
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3.4
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26
14
28
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10
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28
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2.0
21
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1.95
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3.6
175
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0
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24
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1.95
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3.2
304
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2.5
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16
10
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17
3.5
15
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9
60
35
16
10
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1.83
3531728--3531818
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4.9
19
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152
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16
10
36
1.84
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21
2.0
21
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2.2
24
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25
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2.0
21
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17
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0
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0
0
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23
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31
2.3
31
75
11
76
39
9
1
49
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
3552663--3552710
24
2.0
24
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0
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0
2
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1.12
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31
2.6
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10
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44
4
2
48
1.36
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3.4
13
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68
0
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0
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0
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1.8
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93
0
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28
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2.6
22
78
13
64
46
6
1
44
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438