Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  298  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93350678--93350895
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22
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1.99
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2.2
40
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25
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1.99
93381095--93381236
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24
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2.0
70
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28
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1.98
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247
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31
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39
3.9
39
92
0
252
23
32
20
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1.98
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48
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54
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0
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0
0
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1.90
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3.8
57
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230
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17
16
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93446148--93446198
6
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1
15
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1.58
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2.0
23
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2
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17
3.1
18
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12
60
40
1
16
40
1.59
93446401--93446461
28
2.2
28
91
5
97
60
0
6
32
1.22
93446582--93446728
40
3.5
39
69
23
118
61
2
12
22
1.44
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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65
5
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20
1.42
93446693--93446975
120
2.4
118
80
12
319
60
2
11
25
1.44
93446843--93446876
17
2.0
17
100
0
68
52
5
11
29
1.61
93446763--93447070
118
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120
80
12
307
59
2
11
26
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1.9
32
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0
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22
1.65
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2.2
20
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20
1.46
93448483--93448705
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1.53
93449176--93449375
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1.81
93449213--93449374
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54
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5
211
45
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12
24
1.83
93449234--93449425
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16
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1.88
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28
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0
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15
3.9
15
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1.44
93468207--93468255
25
2.0
24
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1.58
93468211--93468252
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13
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2.1
31
100
0
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30
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2.1
37
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18
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2.0
22
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27
4.1
27
80
7
120
15
22
23
39
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93491033--93491144
54
2.1
54
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145
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1.91
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1.12
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17
25
18
1.92
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11
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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3
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0
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129
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18
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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1.75
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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22
26
2.00

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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