Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  394  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122837829--122838001
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3.9
44
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1
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18
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1.97
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1.8
88
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29
19
22
29
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1.9
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0
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31
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22
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1.97
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2.3
44
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0
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1.98
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2.0
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0
225
30
19
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23
1.98
122848526--122848570
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3.0
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57
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0
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26
2.7
26
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16
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23
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2.8
25
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24
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2.1
25
96
0
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62
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1.69
122866713--122866758
21
2.3
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0
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5
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0
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18
0
2
78
0.86
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0
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21
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0
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0
35
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1.57
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2.9
108
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393
27
18
20
33
1.96
122879219--122879287
26
2.7
26
84
4
86
18
24
20
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122879230--122879302
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2.8
26
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2
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16
26
23
34
1.95
122879240--122879382
24
5.8
24
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12
67
19
25
20
33
1.97
122884998--122885036
21
1.9
21
89
5
62
23
12
0
64
1.28
122884982--122885036
22
2.5
22
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11
60
25
12
0
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1.9
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59
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11
5
70
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122885118--122885188
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2.6
27
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2.2
21
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26
6
2
65
1.28
122885615--122885724
22
5.0
22
68
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68
20
11
0
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17
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16
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57
19
14
0
66
1.25
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2.0
21
90
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21
12
2
63
1.40
122885699--122885746
21
2.2
21
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60
22
10
2
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1.35
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22
3.1
22
66
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38
0
10
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1.36
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1.9
51
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119
35
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13
34
1.89
122889154--122889509
117
3.0
121
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8
366
32
19
20
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1.97
122892149--122892199
18
2.5
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25
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3
64
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122894061--122894106
23
2.0
24
86
4
67
43
0
2
54
1.12
122894155--122894202
18
2.7
18
83
0
60
70
2
4
22
1.15
122894286--122894356
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1.9
37
82
2
90
60
2
0
36
1.11
122894329--122894382
20
2.8
20
80
2
65
68
1
0
29
1.00
122894083--122894450
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2.1
178
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544
53
4
2
39
1.36
122894617--122894663
23
2.1
21
88
7
67
36
2
0
61
1.08
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
122895252--122895302
25
2.0
25
85
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68
66
1
27
3
1.20
122896484--122896534
16
3.4
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73
13
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45
0
0
54
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2.4
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158
41
12
19
26
1.87
122899342--122899381
12
3.3
13
80
16
50
65
0
27
7
1.20
122899512--122899569
30
1.9
31
82
10
75
24
5
17
53
1.64
122917753--122917817
20
3.3
18
77
16
51
53
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3
36
1.41
122917813--122917857
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2.2
20
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4
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0
2
48
1.13
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2.0
22
90
0
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46
2
2
48
1.27
122919135--122919183
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2
95
0
89
46
0
0
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2
51
1.28
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120
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4
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41
1.57
122924128--122924235
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2.4
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135
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14
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1.94
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2.0
20
100
0
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9
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1.62
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19
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2.2
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25
0
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23
23
0
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13
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0
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0
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27
2.0
27
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3
23
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2
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44
0
0
55
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27
2.0
27
83
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69
43
0
0
56
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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21
23
13
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1.90
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0
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1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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0
0
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0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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2.3
82
83
7
218
25
17
21
35
1.95

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438