Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  6  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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56
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Indices
Period
Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
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Score
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2
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2
0
56
1.13
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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18
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51
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1841034--1841073
17
2.4
17
95
4
73
30
5
10
55
1.54
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17
2.1
17
89
0
54
50
0
16
33
1.46
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11
3.3
11
92
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17
0
0
82
0.67
1848997--1849029
5
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5
86
13
50
18
0
0
81
0.68
1853451--1853484
11
3.3
11
92
8
54
17
0
0
82
0.67
1853451--1853483
5
6.6
5
86
13
50
18
0
0
81
0.68
1860530--1860563
14
2.5
13
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13
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20
0
14
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1.28
1867890--1867928
2
20.5
2
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10
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0
0
46
1.00
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15
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15
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7
66
55
0
0
45
0.99
1867890--1867928
17
2.3
17
100
0
78
53
0
0
46
1.00
1869067--1869137
34
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34
100
0
142
14
19
28
38
1.91
1869548--1869642
49
1.9
49
100
0
190
32
26
9
31
1.88
1882010--1882035
6
4.3
6
100
0
52
0
15
50
34
1.45
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18
1.9
17
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5
59
41
0
0
58
0.98
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24
2.0
24
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4
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29
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1.47
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24
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24
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0
0
60
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0
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1.18
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38
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0
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16
17
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1.90
1894831--1894856
11
2.4
11
100
0
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0
0
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0.96
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2.0
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4
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41
18
6
32
1.77
1897271--1897317
14
3.4
14
80
14
53
40
19
8
31
1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1898799--1898836
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2.0
19
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10
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7
0
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1.28
1899329--1899468
75
1.9
75
81
0
172
29
22
17
30
1.96
1901374--1901440
29
2.4
28
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12
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4
0
40
1.20
1903193--1903236
22
2.1
21
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2
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0
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0
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0
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1
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0
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1.00
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0
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1.00
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0
0
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0.71
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20
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63
7
0
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1.21
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2.0
114
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0
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3.2
8
100
0
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0
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1.75
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18
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2.4
59
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15
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0
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40
14
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20
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5.9
45
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25
26
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1.9
89
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0
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4.8
78
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1
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24
24
19
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1.98
1939588--1939638
25
2.1
24
85
7
68
76
5
0
17
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
1950221--1950306
42
2.0
43
86
2
120
46
4
5
43
1.48
1950785--1950877
30
3.0
30
73
10
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48
1
0
50
1.07
1954487--1954576
29
3.1
27
76
19
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48
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3
41
1.46
1964830--1964868
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2.2
18
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0
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1.71
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0
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1.98
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2.0
21
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0
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0
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0
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1.85
1999669--1999750
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2.6
31
82
1
92
15
3
19
60
1.49

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438