Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  26  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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3.0
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35
14
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26
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2.6
44
85
2
149
35
13
22
27
1.92
6604003--6604136
46
3.0
45
82
4
153
35
14
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0.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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G
T
Entropy
(0-2)
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21
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1
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6620534--6620640
15
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14
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18
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1.9
19
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2.1
30
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90
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29
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82
27
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1.74
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2.0
31
81
6
72
27
9
20
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.0
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43
4
0
51
1.23
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1.30
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5
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1.29
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16
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8
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1.12
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41
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6703232--6703287
12
4.5
12
81
16
69
55
1
0
42
1.10
6713950--6713987
18
2.1
18
85
9
51
39
0
2
57
1.12
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22
2.5
21
80
17
65
46
0
5
48
1.25
6715205--6715273
31
2.2
31
86
0
93
47
4
11
36
1.60
6716094--6716122
4
7.2
4
100
0
58
75
0
24
0
0.80
6716885--6716995
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16
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35
1.95
6718276--6718300
4
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4
100
0
50
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0
24
0
0.80
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2.4
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1.95
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17
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17
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10
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2
0
30
1.03
6720683--6720714
9
3.7
9
95
4
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65
0
0
34
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40
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40
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3
3
30
1.28
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25
2.0
25
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0
102
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0
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14
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68
0
0
31
0.90
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13
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15
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9
56
68
0
0
31
0.90
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27
2.5
27
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0
0
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0
0
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0
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1.74
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25
2.0
25
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7
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70
0
5
23
1.09
6736577--6736613
19
1.9
19
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0
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13
8
5
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1.24
6737252--6737329
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1.9
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117
34
1
3
60
1.23
6737255--6737390
19
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20
68
21
63
38
0
4
56
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6737341--6737396
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20
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41
0
7
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1.29
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31
2.0
31
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0
88
43
11
25
19
1.84
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28
2.1
28
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6
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50
0
1
47
1.11
6740120--6740197
39
2.1
36
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104
48
0
1
50
1.09
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5.4
19
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47
0
1
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1.07
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12
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1.79
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9
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19
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2
2
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1.16
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2.5
21
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12
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54
0
3
41
1.19
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20
4.3
20
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10
95
68
4
1
25
1.16
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2.5
15
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0
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0
0
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1.00
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2.3
18
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50
51
0
0
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1.00
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2
1
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1.26
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0
0
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1.29
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28
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0
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0
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0
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2.0
20
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0
2
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1.05
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12
2.2
12
100
0
52
7
15
30
46
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6792352--6792400
24
2.0
24
96
0
89
53
2
4
40
1.32
6792445--6792592
7
20.9
7
73
8
50
19
0
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43
1.56
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16
0
43
40
1.48
6792532--6792573
15
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15
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50
16
0
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2.1
21
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2
0
50
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3
3
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20
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2.0
33
88
0
98
14
23
14
46
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438