Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  210  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65082477--65082661
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40
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0
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0
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0
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0
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1.20
65110478--65110642
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1
3
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2.2
16
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22
2.0
22
100
0
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2.0
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1.50
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2.0
38
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105
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4
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39
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1.9
22
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0
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1.57
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2.0
24
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22
20
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0
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0
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2.5
23
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10
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77
1
12
8
1.06
65126652--65126683
6
5.5
6
92
7
57
87
0
12
0
0.54
65126640--65126696
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12
82
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78
1
10
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1.02
65131855--65131897
18
2.5
17
80
3
50
48
6
4
39
1.51
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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50
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4
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18
25
31
1.97
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1.9
100
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3
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25
20
23
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1.98
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30
2.0
30
100
0
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25
2.0
25
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36
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42
1.70
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2.0
25
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24
1.96
65162600--65162821
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2.3
96
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22
1.96
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0
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2
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2.1
25
85
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70
28
19
21
30
1.97
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25
2.6
25
90
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24
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2.00
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20
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4.2
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1.81
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1.9
54
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19
41
1.81
65189427--65189549
54
2.3
54
82
2
140
28
8
21
42
1.81
65189581--65189672
27
3.4
27
86
0
130
40
8
22
28
1.84
65191797--65191888
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13
72
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34
18
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1.62
65191804--65191921
27
4.5
24
70
17
58
35
18
1
44
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65191797--65191915
40
3.0
39
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7
141
35
19
1
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1.61
65193324--65193420
41
2.3
40
82
7
104
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27
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25
1.97
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20
2.0
20
100
0
82
21
14
19
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1.87
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29
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29
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16
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1.95
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3.6
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29
33
16
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1.95
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25
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27
23
2.00
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3.8
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155
25
22
27
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2.00
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2.4
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85
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18
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30
1.97
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3.1
29
64
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21
12
25
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1.89
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56
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1.99
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27
27
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42
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1.81
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78
36
10
19
34
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65255452--65255529
24
3.2
24
87
7
104
25
21
21
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65255461--65255542
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24
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11
114
29
19
21
29
1.98
65255751--65255879
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3.7
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14
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14
24
25
1.93
65255768--65255874
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0
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1.92
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40
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4
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24
1.99
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17
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1.84
65266705--65266753
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19
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10
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25
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20
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1.97
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15
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0
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28
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2
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1.10
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2.0
52
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9
118
50
0
5
42
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65309976--65310062
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26
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1.94
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2.5
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1.94
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1.97
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27
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5.9
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0
380
23
27
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65416662--65416838
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4.4
40
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4
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24
22
27
25
2.00
65416662--65416838
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2.2
80
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22
27
25
2.00
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0
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0
0
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1.95
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1.96
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37
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1.98
65432460--65432598
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1.9
73
86
4
199
25
28
17
27
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438