Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  396  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123432970--123433026
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2.5
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1
33
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0
0.61
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0
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25
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13
22
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18
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14
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30
13
5
50
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2.1
30
90
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19
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29
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2.3
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0
0.58
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0
2
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18
2.0
18
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5
63
20
40
22
17
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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2
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70
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1
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3.1
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20
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4.2
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1.82
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23
29
1.81
123535076--123535136
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2.0
31
100
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2.0
30
100
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1.71
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2.3
25
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1.95
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143
26
16
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34
1.95
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2.2
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39
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0
0
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2.1
30
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5
101
58
11
3
26
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
123549165--123549231
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2.1
32
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5
52
1.66
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17
2.8
17
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6
51
53
4
0
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1.20
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29
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4
45
1.40
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2.5
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56
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1.30
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4
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1.24
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1
5
50
1.36
123587497--123587559
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2.1
30
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5
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4
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1.51
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2.0
31
93
0
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12
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32
1.92
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30
2.1
30
93
0
106
22
22
33
20
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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29
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21
1.98
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3.9
46
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29
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21
1.98
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0
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0
0
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19
28
1.98
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20
29
1.98
123630570--123630888
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95
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23
27
20
29
1.98
123643941--123644137
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2.00
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2.3
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0
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0
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2.0
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28
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0
23
0
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0.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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1.9
122
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310
36
3
4
55
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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0
0
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0
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0
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2.1
61
84
3
164
42
13
2
42
1.57

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438