Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  368  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114782032--114782083
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2.0
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1.98
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2.4
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245
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20
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1.99
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28
19
27
1.99
114819441--114819649
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2.2
96
79
1
222
25
27
18
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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4
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23
27
19
30
1.98
114827037--114827358
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2.2
144
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23
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19
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1.98
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2.3
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155
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1
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0
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50
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3.3
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3
28
1.40
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6
3
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2.2
18
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62
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1.98
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1.97
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0
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114848215--114848261
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21
0
29
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2
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1.67
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26
2.4
24
83
8
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68
3
0
28
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
114848884--114848942
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1.12
114849339--114849391
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45
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1.9
16
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20
10
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358
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1.8
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0
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1.13
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19
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37
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2.8
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10
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1
14
1.52
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438