Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  32  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Indices
Period
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Copy
Number
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Indels
Score
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Indices
Period
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Number
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Score
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23
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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29
19
23
26
1.98
8026937--8027026
17
5.4
17
68
10
60
28
24
23
23
1.99
8026932--8027047
33
3.4
33
78
7
117
29
24
23
23
1.99
8026937--8027047
34
3.3
34
78
7
102
29
25
23
21
1.99
8028654--8028686
2
16.5
2
100
0
66
51
0
0
48
1.00
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14
2.7
14
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0
67
55
2
7
34
1.43
8029132--8029186
28
2.0
28
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1
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1.41
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9
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0
3
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1.18
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15
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14
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60
0
3
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1.18
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19
10.8
19
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1
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19
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1
3
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1.23
8029401--8029487
26
3.3
27
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99
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2
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32
1.29
8029454--8029501
16
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15
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8
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4
4
27
1.30
8029305--8029509
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2.5
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77
17
199
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1
3
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1.22
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2.4
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9
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26
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3
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1.14
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2.7
13
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66
0
2
30
1.06
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94
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95
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10
223
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1
5
31
1.28
8031022--8031081
16
3.8
16
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17
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1
5
30
1.25
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20
2.4
17
82
14
52
68
0
2
29
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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22
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1
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1.21
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206
3.0
206
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0
1018
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19
19
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1.96
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44
2.4
44
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26
27
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29
1.96
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15
3.5
15
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15
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20.5
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0
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0
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0
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0
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7
10.7
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5
53
37
40
0
22
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8078780--8078864
21
3.9
21
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11
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1
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8078764--8078857
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0
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1.66
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2
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18
21
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1.94
8079028--8079277
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2.0
123
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0
0
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0
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15
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9
60
35
16
10
37
1.83

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438