Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  422  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130658639--130658703
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2.5
26
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0
0
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23
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0
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0
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0
0
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0
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20
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17
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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16
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24
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0
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28
26
1.98
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27
27
1.98
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55
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1.93
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44
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4
152
34
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27
1.93
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17
2.2
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5
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1.94
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0
0
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2.5
131
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347
34
16
18
30
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130763427--130763679
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1.9
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2
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18
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1.93
130764358--130764390
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11.0
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87
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66
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30
1.06
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14
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0
10
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1.90
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1.72
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2.1
17
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28
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18
37
1.91
130782202--130782508
90
3.4
91
83
8
301
29
15
18
36
1.92
130784316--130784414
39
2.6
39
77
4
103
53
5
6
35
1.48
130784494--130784527
17
2.0
17
88
0
50
2
50
32
14
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130784908--130784994
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2.1
41
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12
108
3
5
17
73
1.17
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14
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14
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10
50
0
9
3
87
0.63
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88
14.9
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17
300
34
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17
27
1.95
130785745--130785806
30
2.1
30
90
6
99
41
29
9
19
1.83
130785902--130785936
14
2.6
14
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4
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51
5
14
28
1.65
130785954--130786482
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33
19
18
29
1.95
130786321--130786482
74
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75
85
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222
32
20
18
28
1.97
130786151--130786800
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3.9
165
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20
18
27
1.96
130786476--130786646
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5
220
32
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1.96
130786558--130786798
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2.8
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6
310
34
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17
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1.96
130786732--130787041
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2.5
124
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3
525
34
22
16
26
1.95
130786950--130787139
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2.7
70
83
8
237
37
23
14
24
1.92
130796603--130796638
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2.3
15
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0
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2.7
29
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7
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130796634--130796668
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5
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4
5
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130797436--130797495
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3.0
20
73
17
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31
5
5
58
1.41
130797610--130797657
16
3.1
15
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60
31
4
2
62
1.26
130797610--130797661
8
6.5
8
78
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30
3
1
63
1.23
130798992--130799161
51
3.2
50
72
14
144
50
11
4
34
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130799125--130799198
32
2.2
34
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48
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1
33
1.54
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2.0
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0
0
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2.0
25
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0
0
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0
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35
1.58
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22
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2
2
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1.62
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17
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16
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1.70
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2.0
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1
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1.88
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4.0
133
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0
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29
1.98
130882563--130882678
45
2.5
46
80
1
135
29
20
25
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
130884607--130884641
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2
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0
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0
0
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1.00
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3
45
1.24
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13
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1.74
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183
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1.72
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1.68
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4
2
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1.35
130904222--130904289
30
2.3
30
82
5
75
38
4
2
54
1.36

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
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          433   434   435   436   437   438