Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  364  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113673457--113673527
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2.4
29
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14
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1.95
113676730--113676895
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4.6
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10
25
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113676730--113676900
75
2.4
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210
29
11
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1.90
113680627--113680810
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2.5
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0
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27
25
25
22
2.00
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2.1
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23
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0
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4
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1.50
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28
3.1
28
62
28
69
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2.4
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22
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1.99
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28
26
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0
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2.0
42
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36
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
18
31
1.96
113734431--113734503
18
4.1
18
77
13
69
31
20
17
30
1.96
113734437--113734517
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2.2
36
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19
19
30
1.97
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22
2.2
22
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0
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0
0
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0
10
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16
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11
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5
27
1.48
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2.7
305
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59
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5
27
1.48
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19
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0
30
0
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90
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56
55
0
25
19
1.43
113783741--113783805
21
3.1
20
72
10
58
10
30
33
24
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113790799--113790848
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0
0
40
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2.1
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0
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32
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0
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1.9
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22
1.99
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3.2
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23
15
32
1.95
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51
3.2
50
91
1
248
29
23
15
32
1.95
113812685--113812924
3
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3
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14
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9
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2.8
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1.33
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10
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16
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6
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0
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0
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18
1.33
113830440--113830532
36
2.6
36
77
12
111
54
1
9
34
1.40
113830557--113830588
16
2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71
113830692--113830734
16
2.8
15
86
6
59
62
0
6
30
1.21
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
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0
50
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0
0
32
0.90
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3
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3
100
0
82
65
0
0
34
0.93
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24
2.1
24
92
0
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45
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3
27
1.70
113831463--113831521
24
2.6
23
86
5
75
38
23
3
33
1.72
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48
4.2
48
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0
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6
24
31
1.82
113839570--113839771
96
2.1
96
96
0
368
37
6
24
31
1.82
113839762--113839787
2
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2
100
0
52
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0
0
50
1.00
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1.9
64
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0
199
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19
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1.76
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112
2.0
112
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0
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48
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0
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113840016--113840162
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25
1.97
113841366--113841541
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3.8
46
77
11
180
21
19
28
30
1.97
113841362--113841533
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1.8
93
88
2
265
20
19
29
29
1.97
113846409--113846584
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10
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21
21
29
28
1.98
113846407--113846576
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1.8
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94
0
304
21
21
29
27
1.99
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14
2.1
14
100
0
58
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6
58
1.50
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2
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2
100
0
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0
0
50
1.00
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3.7
19
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16
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35
0
7
57
1.26
113851474--113851526
20
2.7
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32
0
7
60
1.25
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11
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0
0
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113860588--113860620
17
2.0
17
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5
59
45
0
0
54
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113860722--113860897
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1.9
91
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2
273
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26
25
1.84
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40
5.6
39
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8
277
25
22
26
25
2.00
113869718--113869971
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3.3
77
79
10
225
25
22
26
25
2.00
113877779--113877996
38
5.6
39
85
6
259
25
22
27
25
2.00
113877779--113877996
78
2.8
79
83
8
261
25
22
27
25
2.00
113877830--113878031
79
2.6
77
83
9
225
25
21
27
25
2.00
113883299--113883391
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1.9
48
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0
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23
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1.98
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1.76
113883994--113884061
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2.5
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0
100
45
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1.76
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5
308
27
27
18
26
1.98
113886890--113887173
100
2.8
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363
27
27
19
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1.99
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150
2.0
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89
0
453
26
27
19
26
1.99
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27
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1
0
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1.09
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61
1
0
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1.06
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2
19.5
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100
0
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0
0
1.00
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2
19.5
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100
0
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0
0
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1.00
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29
29
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1.95
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4.2
29
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104
29
28
13
28
1.94
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2.1
24
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0
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2.2
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19
1.90
113900403--113900460
29
2.0
29
86
3
82
31
27
12
29
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113906134--113906456
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7.6
43
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2
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30
33
25
10
1.90
113906134--113906456
85
3.8
86
92
2
555
30
33
25
10
1.90
113906121--113906456
169
2.0
171
93
2
579
30
33
25
11
1.90
113906449--113906556
38
2.8
38
88
0
153
27
27
23
21
1.99
113910154--113910256
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2.1
48
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17
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1.97
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30
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9
1.88
113911887--113912122
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1.9
126
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1.88
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23
1.99
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50
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1.86
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22
3.8
21
77
14
72
28
7
1
61
1.32

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          401   402   403   404   405   406   407   408   409   410   411   412   413   414   415   416   
          417   418   419   420   421   422   423   424   425   426   427   428   429   430   431   432   
          433   434   435   436   437   438