Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  263  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81692651--81692738
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3.0
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3.0
30
81
8
99
10
17
15
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1.66
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27
2.6
27
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26
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233
20
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27
1.98
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83
0
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17
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1.64
81707309--81707396
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3.0
30
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99
10
17
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20
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19
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0
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0
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0
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2.4
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29
24
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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22
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1.99
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2.0
82
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2
280
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0
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2.0
111
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2.5
25
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1.94
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2.3
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18
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1.94
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6
117
26
18
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1.92
81772125--81772232
27
4.0
26
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5
135
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1.95
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19
1.93
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3.2
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26
26
21
26
1.99
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2.3
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217
26
26
21
26
1.99
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2.9
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38
19
20
20
1.93
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22
2.7
22
81
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22
25
20
1.98
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21
19
1.94
81780787--81780949
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4.2
39
91
0
254
22
19
33
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81782430--81782545
27
4.3
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25
19
18
37
1.94
81783521--81783566
23
2.0
23
95
0
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43
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1.61
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27
2.5
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25
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27
1.94
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27
2.5
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32
25
14
27
1.94
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29
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25
1.97
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3.0
26
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137
32
15
24
26
1.95
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29
5.5
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27
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2.00
81822064--81822232
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2.1
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22
27
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6
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6
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1
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20
5
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64
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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24
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30
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438