Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  403  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125517496--125517667
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93
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29
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20
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20
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1.98
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29
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3.2
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24
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3.0
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37
24
24
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1.93
125619849--125619912
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3.3
19
72
12
67
37
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25
14
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
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45
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24
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2
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42
1
0
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1.07
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58
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2.1
24
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13
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26
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22
1.96
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2.5
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285
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23
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1.9
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50
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42
1.20
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19
90
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2.2
19
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4
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21
2
4
70
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125656450--125656498
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2.0
23
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1.52
125657492--125657591
52
2.0
51
86
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141
44
16
12
28
1.83
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11
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1.78
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2.2
26
96
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35
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17
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1.93
125665061--125665121
19
3.3
19
90
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99
39
14
8
37
1.76
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1.9
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199
26
22
18
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1.97
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1.9
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714
26
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25
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1.89
125707859--125708030
74
2.4
74
85
10
225
31
10
24
33
1.89
125714496--125714661
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4.6
35
82
8
172
31
10
24
33
1.90
125714496--125714666
75
2.4
75
85
7
221
31
11
23
33
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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35
4.3
34
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174
32
12
27
26
1.93
125722009--125722157
70
2.2
68
86
4
201
32
12
27
26
1.93
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13
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14
201
29
10
13
46
1.77
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27
2.4
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41
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1.92
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2.0
223
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16
17
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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22
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1.9
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1.96
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114
29
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29
1.94
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0
0
39
0.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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0
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25
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2.1
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0
177
19
13
10
55
1.67

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          433   434   435   436   437   438