Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Chr03 135709677 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  15  of  438  ( 52554 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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0
32
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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143
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22
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17
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
4393253--4393481
44
5.3
44
71
12
222
19
24
21
34
1.97
4393135--4393580
86
5.2
86
88
3
567
20
22
21
35
1.96
4393204--4393580
42
8.8
41
68
12
211
19
23
20
35
1.96
4393135--4393580
172
2.6
171
86
4
635
20
22
21
35
1.96
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23
2.0
23
95
4
83
22
8
11
57
1.60
4413212--4413258
23
2.1
22
84
11
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34
0
6
59
1.23
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28
2.1
27
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9
64
31
1
0
67
1.01
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30
2.0
30
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100
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1
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2.0
61
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139
42
15
2
38
1.61
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3
13.7
3
100
0
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0
0
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0.90
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0
50
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0
0
32
0.90
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2.0
29
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10
1
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12
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10
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18
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43
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40
2.3
40
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5
118
27
9
12
49
1.72
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30
1.9
29
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3
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21
24
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19
1.96
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29
2.0
30
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5
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1.65
4458264--4458333
29
2.3
29
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0
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23
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0
0
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12
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0
58
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0
0
68
0.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4474433--4474512
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0
1
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2.6
24
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0
1
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1.9
16
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0
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0
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5
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0
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0
0
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0
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0
0
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0
0
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0
3
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19
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176
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4.2
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14
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70
0
0
29
0.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
4528187--4528225
16
2.4
16
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5
0
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3.5
13
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50
0
4
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0
15
0
0.63
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0
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0
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2
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3.6
162
83
7
698
28
17
19
34
1.94

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438