Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  402  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
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0
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13
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2.0
20
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50
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0
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2.0
20
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1.00
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2.3
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6
8.0
6
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2
29
18
1.59
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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2
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1.14
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1
0
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6.5
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6
69
15
0
0
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0.63
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3.1
17
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15
1
0
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2.5
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23
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18
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329
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2.0
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100
0
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4.7
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1.12
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0
0
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27
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1.98
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2.1
19
90
0
62
55
0
12
32
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
125349721--125349770
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1.93
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2.6
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149
35
13
22
27
1.92
125365810--125365943
46
3.0
45
82
4
153
35
14
23
26
1.93
125370961--125371007
20
2.4
20
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10
8
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1.70
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27
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46
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184
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Size
Copy
Number
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Percent
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Percent
Indels
Score
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T
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28
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
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30
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2.0
21
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4
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37
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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18
29
23
29
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438