Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  191  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59296708--59297021
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69
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22
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36
1.95
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1
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51
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55
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317
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1.98
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46
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216
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1.98
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17
2.5
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22
53
34
23
17
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1.96
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43
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23
17
31
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4
16
64
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1.98
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1.98
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310
26
29
22
21
1.99
59433093--59433270
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4.5
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2
315
26
29
23
20
1.98
59439632--59439664
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2.6
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50
9
45
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112
18
24
24
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1.97
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27
3.2
28
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20
26
20
31
1.98
59440897--59441011
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18
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22
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1.96
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2.3
28
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29
1.85
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23
24
32
1.98
59448707--59448797
27
3.2
28
78
4
76
21
25
20
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
59452510--59452682
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46
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201
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1.97
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1.8
93
92
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19
29
29
1.98
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2.9
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3.0
30
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1.88
59508197--59508262
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34
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0
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4
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25
2.1
25
96
0
95
28
9
11
50
1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3
1
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1.28
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143
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28
1.94
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0
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0
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19
1.95
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22
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1.97
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1.96
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1.82
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54
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1.81
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28
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0
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19
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19
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.98
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1.99
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1.98
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232
28
29
21
20
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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27
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26
1.99
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27
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1.99
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26
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2.00
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3.0
30
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1.65
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20
1.98
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3.8
46
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10
232
28
29
21
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          433   434   435   436   437   438