Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  50  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12684485--12684556
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1.98
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0
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17
0
0
82
0.66
12692708--12692742
16
2.1
17
94
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17
0
0
82
0.66
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2.0
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22
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2.9
27
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10
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269
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24
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1.84
12736205--12736493
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53
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215
32
24
7
34
1.85
12736414--12736551
56
2.5
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4
163
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18
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1.81
12736407--12736551
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5.3
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141
40
20
8
30
1.82
12736610--12736700
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0
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24
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28
23
22
25
1.99
12738061--12738225
71
2.3
70
87
4
224
28
23
22
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12738419--12738482
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2.1
31
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14
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1.93
12741513--12741557
22
2.0
22
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17
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37
1.81
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1.9
21
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32
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20
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29
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26
27
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24
1.99
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5
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2.1
21
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11
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15
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12770577--12770634
22
2.6
22
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7
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17
5
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1.72
12770613--12770666
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1.79
12770785--12770824
20
2.0
20
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12771016--12771215
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4.5
45
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23
20
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1.97
12771229--12771522
155
1.9
156
89
2
457
23
23
20
32
1.97
12777998--12778054
9
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12777997--12778071
20
3.8
20
91
6
111
37
9
18
34
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
12778016--12778071
11
5.5
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19
32
1.86
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3.8
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135
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23
28
1.99
12786077--12786151
20
3.8
20
87
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102
36
10
18
34
1.86
12786097--12786151
11
5.4
11
70
16
55
36
10
20
32
1.87
12786201--12786298
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23
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1.99
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0
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17
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0
0
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2.0
25
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0
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32
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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(0-2)
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28
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202
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202
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34
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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17
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48
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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36
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438