Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  37  of  438  ( 52554 repeats found )

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Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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Period
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Score
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21
3
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9237984--9238024
18
2.3
19
80
20
52
24
29
17
29
1.97
9250828--9250888
16
4.0
15
79
10
61
63
0
0
36
0.94
9250829--9250889
13
4.8
13
72
10
54
65
0
0
34
0.93
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34
5.7
34
82
9
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32
25
12
29
1.93
9260137--9260329
69
2.8
69
85
3
255
31
25
12
30
1.93
9260136--9260329
103
1.9
104
87
5
286
31
25
12
29
1.92
9266497--9266728
35
6.7
34
81
6
270
31
25
13
29
1.94
9266499--9266728
104
2.2
104
87
3
320
31
25
13
30
1.93
9266500--9266728
69
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69
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0
341
31
25
13
30
1.93
9268850--9268896
20
2.3
20
81
0
58
31
21
12
34
1.91
9274118--9274185
33
2.1
33
100
0
136
30
4
11
52
1.57
9275388--9275498
40
2.8
41
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129
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27
17
24
1.97
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22
3.3
22
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22
21
21
1.96
9279133--9279658
38
12.9
38
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10
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35
16
24
23
1.95
9279131--9279749
38
14.8
43
83
11
562
36
16
23
23
1.94
9279132--9279705
122
4.7
122
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8
697
35
16
24
23
1.95
9279132--9279658
160
3.2
161
88
7
723
35
16
24
23
1.95
9279535--9279749
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2.3
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277
40
13
23
21
1.89
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42
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271
40
23
17
19
1.92
9283469--9283688
83
2.7
83
83
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40
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16
20
1.91
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16
25
22
1.94
9288516--9288853
46
7.7
46
88
6
424
37
15
24
21
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9288429--9288853
122
3.4
122
90
6
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36
16
24
22
1.94
9288638--9288853
91
2.4
92
86
3
292
39
15
24
20
1.91
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25
1.9
25
91
0
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25
20
14
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1.91
9308992--9309047
19
2.8
20
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15
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23
3
1
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1.11
9312637--9312858
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5.3
42
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290
38
24
17
18
1.92
9315014--9315174
23
6.7
23
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12
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21
23
22
1.98
9315036--9315168
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2.8
45
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12
153
33
21
22
22
1.97
9315029--9315152
23
5.3
23
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24
20
1.96
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2.1
19
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0
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1
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1.17
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1.9
18
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0
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0
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0
0
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0
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1.04
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2.0
26
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0
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1.00
9376308--9376351
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2.0
21
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0
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1.02
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96
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17
16
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1.93
9378036--9378631
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12.8
45
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11
279
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18
16
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1.92
9377982--9378454
51
9.7
51
70
14
302
30
16
16
36
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9378406--9378631
87
2.6
86
85
4
299
29
19
16
34
1.94
9382489--9382533
19
2.3
21
82
17
62
40
6
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31
1.80
9383320--9383363
21
2.1
21
100
0
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20
29
0
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1.49
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2.0
391
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0
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18
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1
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1.13
9386811--9386881
20
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19
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1
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1.13
9386811--9386881
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2
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1.98
9395675--9395829
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2.0
76
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5
177
30
20
27
22
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          433   434   435   436   437   438