Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107731268--107731316
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0
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0
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0
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0
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0
0
32
0.91
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2.0
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2.0
22
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0
0
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21
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107785101--107785170
5
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5
80
7
77
58
1
0
40
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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16
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1
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1.07
107785101--107785170
21
3.3
21
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4
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58
1
0
40
1.07
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2.8
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28
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0
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60
0
1
39
1.04
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0
0
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12
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38
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25
1.77
107820486--107820553
34
2.0
34
100
0
136
44
23
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1.76
107821319--107821399
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3
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24
23
23
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107833436--107834037
190
3.2
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18
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1.8
285
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638
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13
19
30
1.90
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2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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52
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1.50
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14
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1.91
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28
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50
1.70
107922988--107923089
54
1.9
53
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2
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4
0
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1.29
107923033--107923087
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2.6
22
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23
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54
7
1
36
1.39
107923375--107923451
27
2.9
28
83
12
83
44
1
3
50
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
50
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0
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2
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0
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0
3
48
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17
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1.45
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0
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27
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18
35
1.94
107929775--107929937
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1.96
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1.9
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28
19
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1.96
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24
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1.96
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19
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1.98
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71
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1.91
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261
2.3
255
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975
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22
14
26
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
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1.93
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44
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44
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2
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27
1.92
107958780--107958913
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4
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26
1.93
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0
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0
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2.0
34
97
2
127
5
14
5
73
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
107994067--107994274
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25
21
26
1.99
107994082--107994272
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2.4
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2.00
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2.00
108002028--108002233
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22
26
2.00
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1.98
108023825--108023996
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1.8
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96
0
317
27
29
21
20
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          433   434   435   436   437   438