Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Chr03 135709677 
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  135709677

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  412  of  438  ( 52554 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128038655--128038698
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4.5
143
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1.97
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20
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1.94
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4
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0
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23
112
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5
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20
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1.94
128083734--128084106
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77
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19
32
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128083540--128084128
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2.7
217
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2
1093
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15
20
31
1.94
128083540--128084128
147
4.1
140
92
4
980
32
15
20
31
1.94
128083560--128084229
147
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142
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16
21
31
1.95
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1.93
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3.0
35
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63
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0
55
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5
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19
78
12
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74
2
10
14
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
128100461--128100524
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2.8
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71
1
18
15
64
1.38
128101084--128101123
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3.1
13
81
0
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37
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7
32
1.82
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2.3
71
100
0
328
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28
17
35
1.94
128102767--128102964
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2.8
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258
20
28
17
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1.95
128111071--128111100
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10.0
3
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0
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0
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2.0
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11
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0
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26
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50
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8
1.74
128138173--128138292
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51
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0
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12
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1.88
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21
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8
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13
11
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1.48
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13
2.0
13
100
0
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0
15
0
0.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
G
T
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(0-2)
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0
0
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0
0
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1
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1.30
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1
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1.31
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9
100
0
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0
0
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2.8
25
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10
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28
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19
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1.93
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16
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15
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50
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1.8
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17
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
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G
T
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0
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1.98
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24
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1.99
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2.0
133
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1.99
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12
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0
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52
16
16
1.76
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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0
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9
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11
52
5
71
5
18
1.24

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          433   434   435   436   437   438